前情提要 ggplot2不能截斷縱坐標腫么辦講了幾種截斷方法，各有長短，我在這篇文章發(fā)出去后收到兩個反饋，特來與大家分享? 新方法1.拼圖 出處...
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ggplot2截斷縱坐標--后續(xù) -
biomaRt: 用R愉快檢索BioMart數(shù)據(jù)庫網(wǎng)速慢的原因找到了 R 與 BioMart 數(shù)據(jù)庫的語言接口 (interface) Durinck S, Spellman P, Birney...
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ID轉(zhuǎn)換那點事
在進行測序數(shù)據(jù)下游分析的時候常常需要用到不同的數(shù)據(jù)庫，而這些數(shù)據(jù)庫的分析的輸入文件經(jīng)常是各有區(qū)別，因此我們常常需要將各類ID（ensamble ...
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富集分析后的結(jié)果如何畫chord弦狀圖
Chord Diagram弦狀圖-用來畫富集分析的結(jié)果 前面看的文獻中，有一個很漂亮的圈圖，https://mp.weixin.qq.com/s...
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shinyGEO:零編程基礎(chǔ)分析GEO表達數(shù)據(jù)
GEO（Gene Expression Omnibus），即基因表達數(shù)據(jù)庫，美國國立衛(wèi)生研究院NCBI于2000年創(chuàng)建的公共數(shù)據(jù)庫，具有強大的靈...
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我寫了一個R包，簡化芯片下游分析1.由來 近期由于工作需要，有大批的芯片數(shù)據(jù)等著我分析。我想著簡化一下代碼，一步到位出來差異分析結(jié)果。配合練習(xí)寫R包，今天算是搞定了大頭，分享一...
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gpr格式的芯片原始數(shù)據(jù)處理0.背景知識 參考地址：https://bioconductor.org/help/course-materials/2005/BioC2005...
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genoplotR對基因組比較結(jié)果的展示先運行一段小的代碼 一些數(shù)據(jù)格式的說明 dna_segs： （name，start，end，strand這四項是必須要的col，lty，lwd，...
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annotate: ID 轉(zhuǎn)換終結(jié)者+數(shù)據(jù)包&NCBI查詢Annotation for microarrays Gentleman R (2019). annotate: Annotation for ...
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在火山圖上標記基因要玩圖，離不開哈德雷大神的《R數(shù)據(jù)科學(xué)》，第1章和21章是專門講圖的，我寫過對應(yīng)的筆記：http://www.itdecent.cn/p/4a...
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