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seqkit：fasta/fastq序列統(tǒng)計小工具 -
雜記：seqkit計算fasta序列的長度和gc含量；ggpairs更改配色;ggplot2極坐標添加直線計算gc含量 計算序列長度 ggpairs更改配色 這個只是一種方案，還有好多問題沒有解決，比如如何給下三角和上三角賦予不同的顏色 代碼 歡迎大...
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【塊】Gene id格式轉(zhuǎn)換的多種方法
本文將逐步增加各種方法，有時間再研究各個方法的區(qū)別。每個人在轉(zhuǎn)換id格式時，可能會遇到很多與以下流程不同的情況。比如說gene id有小版本、去...
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bioconvert：各種各樣的生物信息數(shù)據(jù)格式轉(zhuǎn)換工具今天找計算測序覆蓋度的時候發(fā)現(xiàn)了這個工具，github 主頁是https://github.com/bioconvert/bioconvert[...
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Sambamba 快速去除PCR重復(fù)
改軟件可快速去除PCR重復(fù)，較samtools，picard更快 安裝 點擊下載后，減壓縮即可http://lomereiter.github....
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最全Bedtools使用說明--只看本文就夠了1 Bedtools:一個強大的基因組算法工具集 Bedtools是由猶他大學(xué)昆蘭實驗室開發(fā)的基因組算法工具集，它堪稱是基因組分析工具中的瑞士軍...
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一款簡單好用的lncRNA預(yù)測工具：LGC測序技術(shù)的飛速發(fā)展積累了大量轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)，從中也發(fā)現(xiàn)了很多新的轉(zhuǎn)錄本。區(qū)分這些轉(zhuǎn)錄本是蛋白編碼序列還是非編碼序列是基因組注釋和新基因鑒定中的重要研...
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從fastq數(shù)據(jù)到SNV | GATK
00 寫在前面 僅針對人類WGS或WES數(shù)據(jù)，供參考。時間管理某一點：能自動化的工作盡量自動化，不要時間用在毫無意義的重復(fù)上。腦袋好比肌肉，需要...
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Cytoscape中文教程（2）7 支持的網(wǎng)絡(luò)文件格式 Cytoscape可以讀取一下格式的文件，這些文件實際是提供了cytoscape和其他一些工具的接口。 Simple i...
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bioawk
bioawk是awk的超集. bioawk能額外解析的生物數(shù)據(jù)格式 $ bioawk -c help bed:1:chrom 2:start 3...
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