不同的結(jié)構(gòu)變異（structural variation，SV）鑒定工具鑒定出的VCF結(jié)果文件格式不盡相同，但也不是完全沒有規(guī)律可循，主要的格式...
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SV VCF格式的說明及轉(zhuǎn)換 -
SV 合并軟件 SURVIVOR
SURVIVOR 軟件的功能： 1)Simulate SVs and evaluate existing callers.2) Merge an...
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SV工具包SURVIVOR的使用
SURVIVOR 是一套用于模擬/評(píng)估 SV、合并和比較樣本內(nèi)及樣本間 SV 的工具集，其還可對(duì)SV進(jìn)行重新格式化及進(jìn)行統(tǒng)計(jì)總結(jié)，其他詳細(xì)信息也...
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文獻(xiàn)解讀：同源四倍體馬鈴薯單倍型基因組文獻(xiàn) 2022 Molecular Plant Genome architecture and tetrasomic inheritance o...
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【如何拆分多倍體亞基因組？】SubPhaser軟件SubPhaser原文鏈接：https://nph.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/nph.18173[...
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用hifiasm組裝基因組
hifiasm大概是目前為止支持PacBio HiFi數(shù)據(jù)組裝的所有軟件中表現(xiàn)最優(yōu)異的軟件了。它不但能輸出primary assembly re...
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2022-12-09 | 山羊馴化基因的起源●英文題目：《The origin of domestication genes in goats》 ●期刊：Science Advances ...
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2022-12-02 | 普遍滲入促進(jìn)了牛屬物種復(fù)雜的馴化和適應(yīng)●英文題目：《Pervasive introgression facilitated domestication and adaptation ...
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「干活」基因組組裝之前要做的：Genome Survey基因組組裝之前，有一些問題還是需要注意的， genome size是多少？ 評(píng)估得到的genome heterozygosity是多少？ 重復(fù)序...
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SyRI鑒定SVSynteny and Rearrangement Identifier (Syri), 鑒定基因組間SV。以全基因組比對(duì)結(jié)果作為輸入，可識(shí)別不...
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