簡介 ??目前，單細胞技術(shù)發(fā)展迅速，單細胞轉(zhuǎn)錄組測序可以幫助我們獲得組織中每個細胞的基因表達水平，但卻無法獲得對應(yīng)空間位置上的信息?？臻g轉(zhuǎn)錄組技...
投稿
收錄了7篇文章 · 3人關(guān)注
-
空間轉(zhuǎn)錄組去卷積分析工具介紹——CARD -
NBIS系列單細胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析實戰(zhàn)（七）：空間轉(zhuǎn)錄組分析第七節(jié)：空間轉(zhuǎn)錄組分析 在本節(jié)教程中，我們將學(xué)習(xí)空間轉(zhuǎn)錄組的一些分析方法。10X Visium平臺的空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)在許多方面是類似于scRNA-...
-
添加p-value和顯著性標記：ggsignif和ggpubr在數(shù)據(jù)分析過程中，常常需要把組間的顯著性添加到圖形中，但是在ggplot2中實現(xiàn)起來略顯麻煩，幸運的是，有很多R包可以幫助我們實現(xiàn)這一操作，比如...
-
10X單細胞空間聯(lián)合分析之十（RCTD）hello,上一篇文章中，10X空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析之空間注釋（解卷積，STdeconvolve）[http://www.itdecent.cn...
-
10X單細胞（10X空間轉(zhuǎn)錄組）通訊分析之CytoTalk（從頭構(gòu)建信號轉(zhuǎn)導(dǎo)網(wǎng)絡(luò) ）hello，大家好，今天我們來分享一個很好的做細胞通訊的分析軟件，在原有細胞通訊軟件的基礎(chǔ)上更上一層，利用單細胞數(shù)據(jù)從頭構(gòu)建信號網(wǎng)絡(luò)，今天我們就...
-
10X空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析之空間注釋（解卷積，STdeconvolve）hello，大家好，今天我們來分享一個新的空間注釋的方法，當然主要思想還是解卷積，關(guān)于空間轉(zhuǎn)錄組的注釋方法，我已經(jīng)分享了很多了，在這里列舉出來，...
-
10X空間轉(zhuǎn)錄組利用空間位置的個性化分析小結(jié)今天領(lǐng)導(dǎo)非讓寫微信稿，其實我是不太想寫的，但是呢，官大一級壓死人，所以寫的微信稿原版分享給大家，原版是不會有廣告什么的，純粹就是給大家分享一些好...
-
10X空間轉(zhuǎn)錄組的畫圖操作（基礎(chǔ)知識）我們要實現(xiàn)下面這張圖，這是一張10X空間轉(zhuǎn)錄組分析得到的圖 這張圖可以展示基因的區(qū)域表達情況，也可以表示10X單細胞和10X空間轉(zhuǎn)錄組聯(lián)合之后，...
-
10X空間轉(zhuǎn)錄組和10X單細胞數(shù)據(jù)聯(lián)合分析方法匯總大家好，新的一年開始了，我們又要投入到緊張的工作中去了，作為一名10X空間和10X單細胞分析的生信人員，也要開始新一年的工作了，但是，正可謂磨刀...
{var%20f='http://v.t.sina.com.cn/share/share.php?appkey=1881139527',u=z||d.location,p=['&url=',e(u),'&title=',e(t||d.title),'&source=',e(r),'&sourceUrl=',e(l),'&content=',c||'gb2312','&pic=',e(p||'')].join('');function%20a(){if(!window.open([f,p].join(''),'mb',['toolbar=0,status=0,resizable=1,width=440,height=430,left=',(s.width-440)/2,',top=',(s.height-430)/2].join('')))u.href=[f,p].join('');};if(/Firefox/.test(navigator.userAgent))setTimeout(a,0);else%20a();})(screen,document,encodeURIComponent,'','','https://upload.jianshu.io/collections/images/1960890/ST.png', '推薦專題《空間轉(zhuǎn)錄組》（ 分享自 @簡書 ）','http://www.itdecent.cn/c/8fdd1b996204?utm_campaign=maleskine&utm_content=collection&utm_medium=reader_share&utm_source=weibo','頁面編碼gb2312|utf-8默認gb2312'));){kind=link}