1 CD45.1和CD45.2 1.1概述： CD45是存在于除紅細胞和漿細胞之外的造血譜系的所有細胞中的受體連接的蛋白酪氨酸磷酸酶。CD45在...
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2022-11-14 幾個常見免疫學(xué)文獻中成對概念
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利用TRUST4從bulk RNA-seq中重構(gòu)免疫組數(shù)據(jù)
昨天老師發(fā)給我一篇生信女神Shirley Liu的文章，看了里面的內(nèi)容之后感覺很興奮～它可以不做免疫組測序，直接從Bulk RNA-seq或者s...
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免疫組庫多樣性（Richness/Diversity/Clonality）的計算Calculation of repertoire metrics VDJTOOLS的CalcDiversityStats函數(shù)提供了直接計算功能...
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免疫組庫分析實戰(zhàn)/mixcr+vdjtools+R實現(xiàn)使用《OncoImmunology》一篇paper中的數(shù)據(jù)進行實戰(zhàn) 數(shù)據(jù)獲取地址：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/bi...
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使用vdjtools進行免疫組庫分析mixcr與vdjtools是基于java平臺開發(fā)的處理從原始序列到定量克隆型的大量免疫組數(shù)據(jù)的免疫分析軟件，在使用前要確保java環(huán)境是ok的...
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使用mixcr構(gòu)建免疫組庫及下游分析免疫組庫（Immune Repertoire，IR）是指個體在某個特定時間其循環(huán)系統(tǒng)中所有多樣性的T細胞和B細胞的總和，即V(D)J序列多樣性的...
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單細胞研究聯(lián)合T細胞受體分析2022年【最新進展】這篇文章是單細胞轉(zhuǎn)錄組（scRNAseq）和TCRseq聯(lián)合分析的一個綜述，介紹了目前關(guān)于這兩種數(shù)據(jù)聯(lián)合分析的最新進展(2022年)。 1. 介...
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單細胞免疫組庫VDJ——CellRanger結(jié)果解讀（三）一、outs目錄概括 以下是10X官方給出的一個典型的vdj運行后的output 目錄： 二、web_summary.html 文件web_su...
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單細胞免疫組庫VDJ——CellRanger（二）10× Genomics提供了完整的數(shù)據(jù)分析方案，單細胞數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)錄組分析類似，VDJ數(shù)據(jù)也使用CellRanger軟件進行分析，在使用之前，我們先...
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