搬運(yùn)自哈佛生物信息課程：《Introduction to Single-cell RNA-seq》鏈接：https://hbctraining....
投稿
收錄了8篇文章 · 7人關(guān)注
-
單細(xì)胞中的標(biāo)準(zhǔn)化和PCA：哈佛生信課程學(xué)習(xí)（一） -
sc-RAN-seq 數(shù)據(jù)分析||Seurat新版教程: Integrating datasets to learn cell-type specific responses如果只是做單個(gè)樣本的sc-RNA-seq數(shù)據(jù)分析，并不能體會(huì)到Seurat的強(qiáng)大，因?yàn)镾eurat天生為整合而生。 本教程展示的是兩個(gè)pbmc數(shù)...
-
【單細(xì)胞分析】換個(gè)姿勢(shì)標(biāo)準(zhǔn)化單細(xì)胞數(shù)據(jù)簡(jiǎn)介 ??由于單細(xì)胞數(shù)據(jù)的高維度，基因長(zhǎng)度差異，覆蓋度差異及實(shí)驗(yàn)過(guò)程中的偏好性等因素，對(duì)前期數(shù)據(jù)進(jìn)行有質(zhì)量的標(biāo)準(zhǔn)化，對(duì)后續(xù)分析結(jié)果解讀至關(guān)重要。...
-
【單細(xì)胞分析】單細(xì)胞數(shù)據(jù)整合分析哪家強(qiáng)？簡(jiǎn)介 ??目前單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析有不少的挑戰(zhàn)，比如稀疏矩陣，超高維度數(shù)據(jù)降維，批次效應(yīng)校正，聚類(lèi)算法的選擇，多組學(xué)數(shù)據(jù)整合等挑戰(zhàn)。有需求就需要造輪子...
-
單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析的航母-工具包大集合隨著單細(xì)胞RNA測(cè)序（scRNA-seq）數(shù)據(jù)集的逐漸累積，用于分析這些數(shù)據(jù)的工具數(shù)量也在急劇增加。熟悉小張聊科研的同學(xué)都知道，此前小編大大們?cè)?..
-
2019.05 week1: SingleR 全自動(dòng)細(xì)胞類(lèi)型注釋這篇文章是2019年1月14日發(fā)表在Nature Immunology上的一篇文章：Reference-based analysis of lu...
-
Nat Methods | SCENIC: Single-cell regulatory network inference and clusteringSCENIC: Single-cell regulatory network inference and clustering Abstract...
-
系統(tǒng)學(xué)習(xí)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序scRNA-Seq(二)劉小澤寫(xiě)于19.3.16看了一篇綜述，又加了一些擴(kuò)展知識(shí) 文章 這是一篇2017發(fā)表在Genome Medicine上的文章A practica...
-
10xGenomics單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄seurat包提取表達(dá)量畫(huà)小提琴圖10xGenomics單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄seurat包提取表達(dá)量畫(huà)小提琴圖 需求提取表達(dá)畫(huà)小提琴圖對(duì)噪音處理 需求 其實(shí)seurat包已經(jīng)有畫(huà)小提琴圖的...
-
單細(xì)胞學(xué)習(xí)2feature selection 比較不同feature selection方法 單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的確可以一次性對(duì)所有細(xì)胞都檢測(cè)到上千個(gè)基因的...
{var%20f='http://v.t.sina.com.cn/share/share.php?appkey=1881139527',u=z||d.location,p=['&url=',e(u),'&title=',e(t||d.title),'&source=',e(r),'&sourceUrl=',e(l),'&content=',c||'gb2312','&pic=',e(p||'')].join('');function%20a(){if(!window.open([f,p].join(''),'mb',['toolbar=0,status=0,resizable=1,width=440,height=430,left=',(s.width-440)/2,',top=',(s.height-430)/2].join('')))u.href=[f,p].join('');};if(/Firefox/.test(navigator.userAgent))setTimeout(a,0);else%20a();})(screen,document,encodeURIComponent,'','','https://upload.jianshu.io/collections/images/1746261/1555293312.jpg', '推薦專(zhuān)題《Single cell》（ 分享自 @簡(jiǎn)書(shū) ）','http://www.itdecent.cn/c/9813833ed6a1?utm_campaign=maleskine&utm_content=collection&utm_medium=reader_share&utm_source=weibo','頁(yè)面編碼gb2312|utf-8默認(rèn)gb2312'));){kind=link}