2019年的最后一天了,跟大家一起讀一讀文獻吧,基于公共數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)挖掘發(fā)表在 Cancer Immunology Research雜志上,作者單...
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2019年的最后一天了,跟大家一起讀一讀文獻吧,基于公共數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)挖掘發(fā)表在 Cancer Immunology Research雜志上,作者單...
前些天老大布置了WGCNA的作業(yè):下載GSE106292 數(shù)據(jù)集的 Excel表格如何讀入R里面,做出作者文章中那樣的圖,但是分組很復(fù)雜,需要去...
概念 生物標志物,即傳說中的biomarker,是一類可測量的,用來表征疾病狀態(tài)的物質(zhì),通常用于表征: 疾病的狀態(tài)(是否為某種疾病/某種亞型);...
三分文章思路-1 這篇3分文章思路記錄下來,其實前面沒有展示生信的圖圖,但是文章introduction部分,描述了通過TCGA數(shù)據(jù)庫TCGA_...
文章是:Identification of ankylosing spondylitis-associated genes by express...
最近在學(xué)習(xí)處理芯片數(shù)據(jù),遇到一個問題就是芯片數(shù)據(jù)和基因ID之間的對應(yīng)問題。不然感覺自己做出的東西沒有辦法分析。 先來看一下芯片探針與基因直接...
Hadley Wickham 和 RStudio 團隊開發(fā)了一個新的用于文本數(shù)據(jù)讀取的包,那就是readr包。readr包提供了幾個新的函數(shù),能...
細胞類型識別對于單細胞RNA測序(scRNA-seq)研究至關(guān)重要,目前正改變著生命科學(xué)。CHETAH(分級分類輔助的細胞類型表征,CHarac...
Garnett是一個從單細胞表達數(shù)據(jù)中實現(xiàn)自動細胞類型分類的軟件包。Garnett的工作方式是獲取單細胞數(shù)據(jù)和細胞類型定義(marker)文件,...
在單細胞轉(zhuǎn)錄組測序中一個重要的方面就是定義聚類得來的cluster,一個思考的方向就是根據(jù)marker基因來定義cluster的細胞類型(cel...