實驗中經(jīng)常需要從基因組中提取、序列用于設計引物，或者進行基因功能研究等，之前看到別人使用的一個腳本，自己拿來用一下，感覺確實很方便 在網(wǎng)站[ht...
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根據(jù)基因名稱批量提取基因序列 -
SSR (misa + primer3 ) 設計SSR引物
先下載 primer3 和 misa 相關文件 misa 相關文件放在百度云鏈接：https://pan.baidu.com/s/1C4eU30...
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SNP數(shù)據(jù)的AMOVA分析 和 Mantel分析一 AMOVA分析 1 將 VCF 轉換為 arp 格式，定義population PGDspider軟件 2 導入Alrequin 并定義gr...
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使用misa查找ssr位點1. 下載基因組文件，ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/all/GCA/002/864/125/GCA_00...
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用R語言對vcf文件進行數(shù)據(jù)挖掘.6 vcf可視化2目錄 前言[http://www.itdecent.cn/p/729673778e43] 方法簡介[https://www.jianshu.c...
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跟著Nature Genetics學畫圖：R語言ggplot2畫圖展示SNP位點的堿基類型論文是 Pan-genome analysis highlights the extent of genomic variation in cu...
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ppsPCP ：植物存在/缺失變異和泛基因組構建工具
參考：http://www.itdecent.cn/p/ade4fb0c152f[http://www.itdecent.cn/p/ade4...
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火山圖新畫法整理思路：先畫出中間的火山圖，再畫左右兩張放大版的圖，最后用AI將三張圖拼接到一起，鋼筆工具畫出中間連接的小T形，同色的小矩形把連接處的實線蓋住...
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如何利用clusterProfiler獲取最新的KEGG和基因對應關系Y叔的clusterProfiler的一大優(yōu)點就是能夠利用最新的KEGG數(shù)據(jù)庫，而不是停留在最后一個公開版的KEGG數(shù)據(jù)庫(2011-5-15)...
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ComplexHeatmap畫基因突變熱圖(一)數(shù)據(jù)格式如下： 若某個基因在某個樣本中既有deletion又有mutation則以;分隔 結果如下： 其中oncoPrint（）中有些參數(shù)可選，...
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