寫在前面 很久很久以前，我就已經(jīng)寫過 GFF3/GTF 注釋信息的部分提取功能。每一個(gè)GXF文件，往往包含的兩萬個(gè)左右基因（數(shù)萬個(gè)轉(zhuǎn)錄本）的外顯...
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實(shí)用 | 優(yōu)雅地提取部分基因結(jié)構(gòu)注釋信息 -
一張圖一次性展示進(jìn)化樹-Motif Pattern-基因結(jié)構(gòu)，卻不能編輯樹？如題。TBtools的 Amaizing Optional Gene Viewer 早已非常靈活?，F(xiàn)在還有9分鐘就第二天啦，用一張圖回答這個(gè)問題...
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Batch SMART 最強(qiáng)序列特征[結(jié)構(gòu)域]預(yù)測(cè)軟件寫在前面 前天，在學(xué)位論文的完善中，有兩個(gè)疑似ERF成員始終令我困擾。植物轉(zhuǎn)錄因子中有個(gè)超家族AP2，包括兩個(gè)亞家族，一個(gè)也叫AP2，另一個(gè)叫E...
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windows下直接跑MEME suite？對(duì)！任何人都可以。Motif，模式，pattern，如下。我個(gè)人理解為：一組具有類似特征的序列。而在分子序列中，那么就是具有類似分子(如堿基或氨基酸）的序列。 M...
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「BLAST Zone」plus「一鍵進(jìn)化樹」寫在前面 那天夏老師突然給我了一個(gè)電話，大體是提了這么一個(gè)想法，亦即，「BLAST Zone」挺好的，但如果可以加上「One Step ML T...
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TBtools | 多圖合一至強(qiáng)版教程！進(jìn)化樹 + Motifs + 結(jié)構(gòu)域 + 啟動(dòng)子 + 基因結(jié)構(gòu) + ....放一張效果圖，這些，三四年前的東西，我其實(shí)一直懶得說。 寫在前面 “Gene Structure View (Advanced)”這個(gè)功能可以說...
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Tbtools畫tree+motif+基因結(jié)構(gòu)+功能域很多基因家族個(gè)性化分析中，經(jīng)常有基因motif+基因結(jié)構(gòu)的看著還挺高大上的圖片，小編接下來帶你使用Tbtools做出這樣的圖片 準(zhǔn)備作圖文件 （...
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用tbtools進(jìn)行基因家族分析《二》家族成員的確定 找到 ”Batch-CDD"工具，輸入上一步獲得的hitdata.txt文件，以及蛋白序列文件，點(diǎn)擊"start“，對(duì)其結(jié)構(gòu)進(jìn)行...
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tbtools 用pfam做基因蛋白domain圖pfam 尋找多個(gè)基因的domain tbtools需要的是 郵箱的文件，把空格替換成制表。
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TBtools:基因家族分析簡(jiǎn)單流程寫在前面：非常感謝CJ開發(fā)出如此強(qiáng)大的TBtools工具。作者（CJchen-0410）在B站上有新手教程，大家可以給大神點(diǎn)個(gè)關(guān)注。 本文以《G...
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