這是我聽孟浩巍知乎Live：生信進階第1課-重復Nature文章和B站視頻：高通量測序技術交流錄像里的筆記哦~ 目錄：文章的主要結論解讀傳統(tǒng)RN...
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解析單細胞RNA-Seq Nature文章 -
10X空間轉錄組數(shù)據(jù)分析之空間細胞密度hello，大家好，今天禮拜天，天津霧霾嚴重，呆在家里學習一下吧。今天給大家分享的是空間轉錄組的空間細胞密度的分析，這個分析非常重要，下面是一張...
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10X Genomics的空間轉錄組技術全攻略--空間基因表達實驗
本次主要介紹透化、反轉錄、cDNA合成及文庫構建，需要1-1.5天。樣本準備以及固定染色之前已經(jīng)詳細介紹過了。 樣本冷凍包埋，H&E染色或熒光免...
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10X Genomics的空間轉錄組全攻略--組織透化優(yōu)化實驗（Tissue Optimization）
組織優(yōu)化（TO, Tissue Optimization）實驗，主要是用于檢測樣本是否適合進行空間轉錄實驗，以及摸索最佳透化時間。不同的組織類型...
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高質量分析！10x空間轉錄組新分析思路10x Visium空間轉錄組已經(jīng)陪伴我們快2年了。隨著時間的推移，我們對空間轉錄組的認識已經(jīng)不僅僅是一開始能夠知道基因表達的空間位置那么簡單，...
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單細胞smart-seq2建庫原理應用單細胞測序技術研究科學問題越來越普遍，當下應用最火熱的是10X Genomics公司的解決方案，但是在某些特殊或者少量細胞樣本的單細胞轉錄組...
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空間轉錄組測序：助力臨床空間分子組學研究
單細胞檢測技術的發(fā)展為理解組織中細胞的組成與功能提供了手段。但是，現(xiàn)有的方法雖能檢測到細胞類型，卻無法真實還原在組織中的空間位置。最新的空間轉錄...
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Seurat 分析Visium空間轉錄組一、Seurat v3.2 對空間轉錄組Visium的結果分析中實現(xiàn)的功能： 歸一化 降維和聚類 檢測空間可變特征(spatially-vari...
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單細胞轉錄組建庫原理：SMART、TargetAmp和10X genomics要實現(xiàn)單細胞mRNA測序，需要解決2個難題：1. 一個人類細胞中，RNA總量大約只有10pg左右（1pg=10-12g），其中mRNA的量大約只...
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單細胞CNS文章復現(xiàn)Single-cell profiling of tumor heterogeneity and the microenvironment in advanced non-s...今天要復現(xiàn)的這篇文獻來自新鮮出爐的NC。 這篇是關于肺癌的。作者通過對42例晚期肺癌進行單細胞測序，描繪了晚期肺癌的單細胞微環(huán)境圖譜，為肺癌的精...
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