今天給小朋友數(shù)據(jù)可視化工具時候，發(fā)現(xiàn)國內(nèi)很多人開發(fā)出來數(shù)據(jù)可視化平臺，可以滿足許多數(shù)據(jù)可視化需要。想著干脆整了一個目錄貼。簡單記錄下來，幾個我不...
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整理貼 | 生物信息學數(shù)據(jù)可視化平臺~國人作品 -
基于orthofinder 結果構建物種樹
串聯(lián)法 orthofinder 已經(jīng)生成好單拷貝基因串聯(lián)的序列，可以直接使用。找到orthofinder 已經(jīng)生成好單拷貝基因串聯(lián)的序列，Spe...
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基因組- genome survey（1）尚未進行基因組測序的物種，在進行基因組測序前，首先需對該物種進行 genome survey。一般通過兩個途徑：細胞遺傳學（這里只講流式細胞術）...
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用MEGA軟件構建NJ樹（Neighbor-Joining）MEGA (Molecular Evolutionary Genetics Analysis)— 分子演化遺傳分析 MEGA是一款操作簡單的系統(tǒng)...
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MEGA構建進化樹如何用MEGA-X構建進化樹_生物研究_實用技巧_科研星球 (51xxziyuan.com)[https://www.51xxziyuan.co...
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構建發(fā)育樹 Bootstrap值
即自展值，可用來檢驗所計算的進化樹分支可信度。Bootstrap幾乎是構建系統(tǒng)進化樹一個必須的選項。一般Bootstrap的值>70%，則認為構...
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使用wgd進行全基因組復制分析這篇教程是我在2019年9月左右分析WGD時的筆記。目前來看，背景介紹和軟件使用說明都基本沒啥問題。但是現(xiàn)在更建議大家使用wgdi進行比較基因組...
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淺談全基因組復制
作者：May審稿：童蒙編輯：amethyst 01 什么是全基因組復制 多倍化（polyploidy）或全基因加倍/復制（whole genom...
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mcmctree估算物種分歧時間推斷物種系統(tǒng)發(fā)育關系以及分歧時間對探討物種起源與演化具有重要意義。通過最大似然法（ML）構建物種進化樹以及估算物種分化時間在比較基因組學的研究進...
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轉錄組重建系統(tǒng)發(fā)育（一）使用fastp多rawdata進行處理rawdata可以是從公司直接獲得的測序數(shù)據(jù)或者是網(wǎng)上下載的數(shù)據(jù)，網(wǎng)上下載數(shù)據(jù)的流程參考使用SRA Toolkit下載NCBI-SRA原始數(shù)據(jù)[...
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