發(fā)育軌跡分析是單細(xì)胞分析中比較常見(jiàn)的一種分析，旨在預(yù)測(cè)出細(xì)胞類型之間的發(fā)育關(guān)系，構(gòu)建細(xì)胞的發(fā)育軌跡。常見(jiàn)的發(fā)育軌跡分析有很多，例如monocle...
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單細(xì)胞分析流程之RNA velocity（一）
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scATAC數(shù)據(jù)分析的正確打開(kāi)方式-Signac
簡(jiǎn)介 單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)是近十年最偉大的科學(xué)進(jìn)展之一，其涵蓋多方面的內(nèi)容。scRNA-seq想必大家都較為熟悉，但是scATAC-seq出現(xiàn)在大家印...
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單細(xì)胞分析之Seurat分析教程（單樣本）
由于Immujent最近比較忙，單細(xì)胞流程的教程就擱置了一段時(shí)間，今天小編繼續(xù)拾起之前的剩下的內(nèi)容來(lái)介紹一下Seurat包。很多單細(xì)胞的分析都是...
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單細(xì)胞分析之發(fā)育軌跡分析（monocle2）
大家好，好久沒(méi)有分享單細(xì)胞分析的流程啦，今天給大家分享一個(gè)單細(xì)胞中常見(jiàn)的分析--細(xì)胞發(fā)育軌跡分析。之前也給大家分享過(guò)RNA velocity，今...
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生信綜述？帶你解鎖高分單細(xì)胞發(fā)文騷操作！
說(shuō)在前面 我們都知道在科研論文中有兩大類：一類是研究型論文；另一類是綜述型論文。其中，前者主要是以研究為主的行文思路，根據(jù)研究發(fā)現(xiàn)的不同發(fā)表在不...
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如何巧妙利用單細(xì)胞核糖體基因發(fā)NAR
說(shuō)在前面 相信很多小伙伴在分析單細(xì)胞數(shù)據(jù)做差異基因分析時(shí)都有這樣的經(jīng)歷：發(fā)現(xiàn)往往差異最明顯的都是那些什么RPL/RPS打頭的核糖體基因。每當(dāng)這時(shí)...
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一文帶你了解單細(xì)胞數(shù)據(jù)基因集打分的所有算法
上一周Immugent寫了一篇一文解決單細(xì)胞亞群注釋的所有問(wèn)題[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI4MjY...
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單細(xì)胞分析流程之Cell Ranger
單細(xì)胞分析流程之Cell Ranger 大家好，我是新加入的小編Immujent，很高興能夠在這里和大家一起學(xué)習(xí)很分享單細(xì)胞的分析流程，以后就請(qǐng)...
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單細(xì)胞基因集打分實(shí)操之irGSEA
Immugent在推文一文帶你了解單細(xì)胞數(shù)據(jù)基因集打分的所有算法[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI4Mj...
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單細(xì)胞分析流程之Cell Ranger結(jié)果解讀
單細(xì)胞分析流程之Cell Ranger結(jié)果解讀 各位小伙伴大家好！ 上期我們說(shuō)到了Cell Ranger的下載、安裝以及常規(guī)的使用方法，這期我們...
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