劉小澤寫(xiě)于2020.5.29這篇文章做了一件事，就是幫助我們區(qū)分不同的批次矯正方法，然后比較了一下優(yōu)劣 文章題目：Flexible compar...
投稿
收錄了51篇文章 · 65人關(guān)注
-
小澤看文獻(xiàn) | 用BatchBench比較scRNA批次矯正方法 -
monocle2 擬時(shí)間分支點(diǎn)分析結(jié)果解讀How to map cell fate to branches? 擬時(shí)間分析結(jié)果有很多重要的結(jié)果，但是這些結(jié)果如何解讀？比如下圖的分支點(diǎn)分析結(jié)...
-
?；鶊D在單細(xì)胞數(shù)據(jù)探索中的應(yīng)用什么是?；鶊D ?；鶊D（Sankey diagram），即?；芰糠至鲌D，也叫?；芰科胶鈭D。它是一種特定類(lèi)型的流程圖，圖中延伸的分支的寬度對(duì)應(yīng)數(shù)...
-
復(fù)現(xiàn)原文（一）：Single-cell RNA sequencing of human kidney（step by step）
https://www.nature.com/articles/s41597-019-0351-8 NGS系列文章包括NGS基礎(chǔ)、轉(zhuǎn)錄組分析 （...
-
讓你的單細(xì)胞數(shù)據(jù)動(dòng)起來(lái)！|iCellR(二)
前情回顧：讓你的單細(xì)胞數(shù)據(jù)動(dòng)起來(lái)！|iCellR(一)在上文我們已經(jīng)基本完成了聚類(lèi)分析和細(xì)胞在不同條件下的比例分析，下面繼續(xù)開(kāi)始啦，讓你看看iC...
-
2019文獻(xiàn)匯總 | 單細(xì)胞與病毒感染
我的單細(xì)胞測(cè)序project主要是做炎癥相關(guān)的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄分析，在檢索paper的過(guò)程中，發(fā)現(xiàn)有關(guān)單細(xì)胞測(cè)序和病毒相關(guān)的文獻(xiàn)是很少的，大致統(tǒng)計(jì)一下...
-
【單細(xì)胞入門(mén)必讀】單細(xì)胞RNA-seq技術(shù)和數(shù)據(jù)分析簡(jiǎn)介
Single-Cell RNA-Seq Technologies and Related Computational Data Analysis...
-
Single-cell RNA-seq denoising using a deep count autoencoder0. 簡(jiǎn)介 這篇文章是2019年發(fā)表在Nature Communications上的使用自編碼器對(duì)單細(xì)胞RNA-Seq數(shù)據(jù)進(jìn)行降噪的工作，通訊作...
-
第10周-單細(xì)胞看小鼠肝臟發(fā)育
單細(xì)胞看小鼠肝臟發(fā)育 肝臟背景知識(shí) 肝臟是一種多倍體器官，由具有一個(gè)或兩個(gè)細(xì)胞核的肝細(xì)胞組成，每個(gè)細(xì)胞核含有2,4,8或更多單倍體染色體組。 肝...
-
10X cellranger 報(bào)錯(cuò)解決辦法越來(lái)越多的同學(xué)開(kāi)始自己嘗試做10X單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析了，除了Linux的基本命令之外，首先用到的軟件是cellranger。失敗是成功之母，對(duì)...
{var%20f='http://v.t.sina.com.cn/share/share.php?appkey=1881139527',u=z||d.location,p=['&url=',e(u),'&title=',e(t||d.title),'&source=',e(r),'&sourceUrl=',e(l),'&content=',c||'gb2312','&pic=',e(p||'')].join('');function%20a(){if(!window.open([f,p].join(''),'mb',['toolbar=0,status=0,resizable=1,width=440,height=430,left=',(s.width-440)/2,',top=',(s.height-430)/2].join('')))u.href=[f,p].join('');};if(/Firefox/.test(navigator.userAgent))setTimeout(a,0);else%20a();})(screen,document,encodeURIComponent,'','','https://upload.jianshu.io/collections/images/1736673/Word_Art_1.png', '推薦專(zhuān)題《scRNA-seq》（ 分享自 @簡(jiǎn)書(shū) ）','http://www.itdecent.cn/c/a593f784ccfa?utm_campaign=maleskine&utm_content=collection&utm_medium=reader_share&utm_source=weibo','頁(yè)面編碼gb2312|utf-8默認(rèn)gb2312'));){kind=link}