前面給大家介紹了?miRNA相關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)及miRNA靶基因批量預(yù)測(cè)[https://link.zhihu.com/?target=http%3A/...
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cytoscape構(gòu)建ceRNA網(wǎng)絡(luò)的輸入文件如何制作 -
轉(zhuǎn)錄組解釋轉(zhuǎn)載三四十頁(yè)的轉(zhuǎn)錄組的測(cè)序報(bào)告不知該如何入手，眾多分析結(jié)果不知該關(guān)注哪些？今天我們就從RPKM到KEGG，慢慢給你講解。 01 什么是RPKM值？ ...
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簡(jiǎn)單的轉(zhuǎn)錄組差異基因表達(dá)分析 -- DESeq2經(jīng)典的轉(zhuǎn)錄組差異分析通常會(huì)使用到三個(gè)工具limma/voom, edgeR和DESeq2。今天我們就通過(guò)一個(gè)小規(guī)模的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)來(lái)演示DESe...
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DESeq2詳解系列(3)接著前兩篇文章：DESeq2詳解系列(1)：http://www.itdecent.cn/p/88511070e2ddDESeq2詳解系列(2...
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一文學(xué)會(huì)常規(guī)轉(zhuǎn)錄組分析
數(shù)據(jù)來(lái)源：Cytosolic acetyl-CoA promotes histone acetylation predominantly at ...
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轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)---從原理到分析(Hisat2+Stringtie+Deseq2)一、 首先放一段illumina測(cè)序平臺(tái)的官方原理鏈接： https://www.bilibili.com/video/BV1Cx411p7dm...
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StringTie + DESeq2 進(jìn)行 RNA-seq 差異基因分析按：RNA-seq 流程非常多樣化，每一個(gè)步驟可選工具都非常多。我的選擇是 StringTie 進(jìn)行組裝取得 read counts 數(shù)值，DE...
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miRNA的下一個(gè)研究浪潮？A-to-I edited miRNA走起！
提到非編碼RNA，大家最熟悉的就是miRNA, miRNA靶基因研究，miRNA-lncRNA研究等等。小編最近發(fā)現(xiàn)了一個(gè)miRNA的新研究...
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R語(yǔ)言繪制火山圖火山圖 火山圖用于展示基因表達(dá)差異的分布，橫軸為L(zhǎng)og2 Fold Change，越偏離中心差異倍數(shù)越大；縱軸為(-1)*Log10 P_adj...
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如何利用cytoscape畫(huà)ceRNA互作網(wǎng)絡(luò)圖？說(shuō)起互作網(wǎng)絡(luò)圖，大家都不陌生?？次墨I(xiàn)的時(shí)候，經(jīng)?？匆?jiàn)相互作用網(wǎng)絡(luò)圖展示了circRNA-miRNA的靶向關(guān)系或者ceRNA競(jìng)爭(zhēng)性網(wǎng)絡(luò)關(guān)系。我們先...
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