findOverlaps findOverlaps - 簡書 (jianshu.com)[http://www.itdecent.cn/p/6...
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找peaks的重疊
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shell玩轉(zhuǎn)各個不同的gtf和gff文件--ID轉(zhuǎn)換雜談玩轉(zhuǎn)gtf 查看gtf每一行的信息 發(fā)現(xiàn)第九行是基因ID 第九行后用';'分隔后的第一行是gene_idimage.png 下載refseq g...
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根據(jù)GTF畫基因的多個轉(zhuǎn)錄本結(jié)構(gòu)
外顯子和內(nèi)含子是轉(zhuǎn)錄本上面的概念，是基于轉(zhuǎn)錄這個行為的定義。 而5端UTR區(qū)域和CDS區(qū)域，還有3端UTR區(qū)域,是基于翻譯這種行為的定義！ UT...
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轉(zhuǎn)錄因子詳細介紹(motif)TF: transcription factor轉(zhuǎn)錄因子TFBS: transcription factor binding site轉(zhuǎn)錄因子結(jié)...
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motif分析——從實戰(zhàn)到原理（Homer篇）一、不求甚解系列 軟件下載及配置 conda安裝： conda install -c bioconda homer 使用configureHom...
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生信 | ATAC-Seq基礎分析+高級分析+多組學分析寫在前面 其實很多作者已經(jīng)探索的差不多了，相關(guān)腳本、教程也很多，但我還是自己系統(tǒng)的總結(jié)一下吧。有時候感覺是浪費時間，但是在寫的時候能發(fā)現(xiàn)并學習到...
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deeptools？還可以這么用！說到deeptools，[https://www.baidu.com/link?url=6F9PeldteljlCkBMSOkg1_W9oDlm...
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生信軟件 | bowtie2（測序序列與參考序列比對）
1. 介紹 Bowtie2 是將測序reads與長參考序列比對工具 (適用于將長度大約為50到100或1000字符的reads與相對較長的基因組...
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trim-galore并行處理時對文件的處理順序
具體流程見trim_galore去接頭(并行處理)命令為 config是需要進行處理的文件列表trim_galore命令這里用的也比較簡單，總結(jié)...
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怎么區(qū)分生物學重復與技術(shù)重復很長一段時間里發(fā)現(xiàn)一個問題，在平常的實驗過程中，有一些童鞋還是會對生物學重復和技術(shù)重復有一些混淆，今天我們徹底再重溫一下。 1、怎么區(qū)分生物學重...
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