原文：TFmapper: A Tool for Searching Putative Factors Regulating Gene Expre...
投稿
收錄了6篇文章 · 1人關(guān)注
-
Week7—TFmapper: 用ChIP-seq/ATAC-seq/DNase-seq數(shù)據(jù)預(yù)測感興趣基因的調(diào)控因子 -
SCENIC | 從單細胞數(shù)據(jù)推斷基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)和細胞類型
在2019/08/07的Nature刊中，中科院景乃禾課題組發(fā)表了文章——Molecular architecture of lineage a...
-
GENIE3——一款預(yù)測基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的R包
在網(wǎng)上隨意瀏覽的時候，無意間發(fā)現(xiàn)另一種可以構(gòu)建調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的軟件，叫做GENIE3。這是一個R包，直接在R里運行。這款R包基于你的表達矩陣來推測基因...
-
GENIE3 || 基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)推斷前情提要：AUCell：在單細胞轉(zhuǎn)錄組中識別細胞對“基因集”的響應(yīng)[http://www.itdecent.cn/p/2fb20f44da67...
-
RcisTarget || 從基因列表到調(diào)控網(wǎng)絡(luò)單細胞技術(shù)正在加強我們對細胞本身的理解。什么是細胞類型，不就是基因選擇性表達的結(jié)果嗎？而基因的選擇表達受到一系列的轉(zhuǎn)錄調(diào)控，在這個意義上，細胞命...
-
AUCell：在單細胞轉(zhuǎn)錄組中識別細胞對“基因集”的響應(yīng)使用AUCell識別單細胞rna數(shù)據(jù)中具有活性“基因集”(i.e. gene signatures)的細胞。AUCell使用“曲線下面積”(Ar...
{var%20f='http://v.t.sina.com.cn/share/share.php?appkey=1881139527',u=z||d.location,p=['&url=',e(u),'&title=',e(t||d.title),'&source=',e(r),'&sourceUrl=',e(l),'&content=',c||'gb2312','&pic=',e(p||'')].join('');function%20a(){if(!window.open([f,p].join(''),'mb',['toolbar=0,status=0,resizable=1,width=440,height=430,left=',(s.width-440)/2,',top=',(s.height-430)/2].join('')))u.href=[f,p].join('');};if(/Firefox/.test(navigator.userAgent))setTimeout(a,0);else%20a();})(screen,document,encodeURIComponent,'','','https://upload.jianshu.io/collections/images/1931387/%E5%BE%AE%E4%BF%A1%E5%9B%BE%E7%89%87_201908151049024.png', '推薦專題《工具 包》（ 分享自 @簡書 ）','http://www.itdecent.cn/c/bfa38815706f?utm_campaign=maleskine&utm_content=collection&utm_medium=reader_share&utm_source=weibo','頁面編碼gb2312|utf-8默認gb2312'));){kind=link}