轉(zhuǎn)座子(transposable element，TE、轉(zhuǎn)座子或跳躍基因)是 DNA 中的一個核酸序列，它可以改變自己在基因組中的位置，有時會產(chǎn)...
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轉(zhuǎn)座元件 -
跟著NC做基因組數(shù)據(jù)分析本期內(nèi)容為[跟著NC做基因組數(shù)據(jù)分析]，這是你需要的教程，對你一定有幫助。 前言今天花費找文章，看到一篇關(guān)于基因組，組裝的文章，主要是里面的圖吸...
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構(gòu)建ncbi——nr本地庫網(wǎng)上方案都是用ncbi-blast+程序包的updata_blastdb.pl自動下載，然而我下了兩天，一直斷···被逼無奈下，我只能用wget...
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線粒體基因組組裝線粒體擁有自身的遺傳物質(zhì)和遺傳體系，但其基因組大小有限，是一種半自主細胞器。除了為細胞供能外，線粒體還參與諸如細胞分化、細胞信息傳遞和細胞凋亡等...
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TaxonKit | A Practical and Efficient NCBI Taxonomy Toolkit一、NCBI Taxonomy 數(shù)據(jù)文件 NCBI Taxonomy數(shù)據(jù)庫將所有生物的分類學關(guān)系組織為一棵“有根樹”（rooted tree）,...
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基因組文章 | 2022《Nature Genetics 》六倍體栽培燕麥的起源與進化燕麥（Avena sativa）作為谷物中最好的全價營養(yǎng)食品，因其富含蛋白質(zhì)、不飽和脂肪酸以及可溶性膳食纖維而廣受消費者青睞。同時，栽培燕麥是六...
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數(shù)據(jù)過濾-Trimmomatic
為什么要進行數(shù)據(jù)過濾 二代測序的下機數(shù)據(jù)經(jīng)堿基識別得到的原始序列稱為raw-data。raw-data中可能含有接頭（adapter）、低質(zhì)量序...
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使用KaKs_calculator計算Ka/Ks的一個小實例更新20181216 今天又把KaKs_calculator2.0的幫助手冊翻出來看了一遍，找到了一句話：Before calculation,...
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用以判斷選擇壓力的Ka/Ks的計算前言 最近在看一些關(guān)于生態(tài)、遺傳、基因組進化等的文獻，其中有個很多人用的也用了很久的用以判斷物種選擇壓力的數(shù)值，（Ka/Ks）。發(fā)現(xiàn)在國內(nèi)的資料...
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Ka/Ks和4DTv計算可視化
參考地址[http://www.itdecent.cn/p/9d28de3d18e6]Ka/Ks和4DTv用于分析基因組的復(fù)制情況，可共線性分...
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