劉小澤寫于19.1.20-21要進(jìn)行GO或者KEGG富集分析，就需要知道每個(gè)基因?qū)?yīng)什么樣的GO/KEGG分類，OrgDb就是存儲(chǔ)不同數(shù)據(jù)庫基因...
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測(cè)序了，然后呢（四）有了OrgDb才能進(jìn)行富集分析 -
構(gòu)建自己物種的orgDb
1.首先安裝eggnog-mapper軟件 注釋所需要的物種數(shù)據(jù)庫網(wǎng)址如下，同時(shí)也可以用里面的腳本download_eggnog_data.py...
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構(gòu)建自己的R包--KEGG.db
參考地址在使用clusterProfiler時(shí)，KEGG注釋包，可以自定義。畢竟許多物種的數(shù)據(jù)庫是不完善的?，F(xiàn)在就自定義一個(gè)KEGG.db的包，...
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