劉小澤寫于19.1.20-21要進(jìn)行GO或者KEGG富集分析,就需要知道每個(gè)基因?qū)?yīng)什么樣的GO/KEGG分類,OrgDb就是存儲(chǔ)不同數(shù)據(jù)庫基因...
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劉小澤寫于19.1.20-21要進(jìn)行GO或者KEGG富集分析,就需要知道每個(gè)基因?qū)?yīng)什么樣的GO/KEGG分類,OrgDb就是存儲(chǔ)不同數(shù)據(jù)庫基因...
1.首先安裝eggnog-mapper軟件 注釋所需要的物種數(shù)據(jù)庫網(wǎng)址如下,同時(shí)也可以用里面的腳本download_eggnog_data.py...
參考地址在使用clusterProfiler時(shí),KEGG注釋包,可以自定義。畢竟許多物種的數(shù)據(jù)庫是不完善的?,F(xiàn)在就自定義一個(gè)KEGG.db的包,...