最近讀到一篇博文，介紹了學(xué)習(xí) RNAseq 數(shù)據(jù)分析非常推薦的兩篇綜述和七個(gè)在線教程并發(fā)表了相關(guān)評(píng)論。本文將進(jìn)行簡(jiǎn)要整理并對(duì)相關(guān)評(píng)論內(nèi)容進(jìn)行大致...
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RNAseq 必讀綜述和在線教程 -
如何解決package 'xxx' is not available (for R version x.y.z)
安裝R語言包的時(shí)候，經(jīng)常出現(xiàn)：package 'xxx' is not available (for R version x.y.z)，搞得人心...
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R語言目錄及文件操作
1.查看目錄與文件 2.檢查目錄和文件 用file_test()可以判斷是一個(gè)目錄還是文件： 3.創(chuàng)建目錄和文件 創(chuàng)建目錄使用dir.creat...
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clusterProfiler: 分析+可視化GO和KEGG富集的轉(zhuǎn)錄組R包寫作之友 基因和基因簇的功能譜 (functional profiles) 的統(tǒng)計(jì)學(xué)分析及可視化 G Yu, LG Wang, Y Han, Q...
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RNA-seq分析實(shí)戰(zhàn)在最最最開始！放上借鑒引用的文章鏈接!(后邊還有)RNA-seq分析：從軟件安裝到富集分析詳細(xì)過程RNA-seq實(shí)戰(zhàn)第二次RNA-seq實(shí)戰(zhàn)總結(jié)...
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R數(shù)據(jù)可視化11:相關(guān)性圖之前我們用熱圖的形式展現(xiàn)了相關(guān)關(guān)系，今天我們來用另外幾種形式來展現(xiàn)相關(guān)關(guān)系的圖。本文代碼來源：Visualize correlation mat...
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三十分鐘學(xué)會(huì)SED
本文承接之前寫的三十分鐘學(xué)會(huì)AWK一文，在學(xué)習(xí)完AWK之后，趁熱打鐵又學(xué)習(xí)了一下SED，不得不說這兩個(gè)工具真的堪稱文本處理神器，誰用誰知道！本文...
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GSEA(Gene Set Enrichment Analysis)富集分析方法 ORA Over-representation analysis過表達(dá)分析，常見的是GO富集分析和KEGG富集分析； FCS fu...
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RNA-seq數(shù)據(jù)分析---方法學(xué)文章的實(shí)戰(zhàn)練習(xí)前言 這次給大家?guī)淼氖?6年發(fā)表在NATURE PROTOCOLS上面的一篇處理RNA-seq數(shù)據(jù)的文章：Transcript-level e...
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「RNA-seq分析軟件」RNA-seq比對(duì)工具STAR學(xué)習(xí)筆記STAR 軟件安裝 軟件的GitHub地址為https://github.com/alexdobin/STAR, 下載頁面為https://gi...
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