簡(jiǎn)介 ??目前單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析有不少的挑戰(zhàn)，比如稀疏矩陣，超高維度數(shù)據(jù)降維，批次效應(yīng)校正，聚類算法的選擇，多組學(xué)數(shù)據(jù)整合等挑戰(zhàn)。有需求就需要造輪子...
投稿
收錄了3篇文章 · 8人關(guān)注
-
【單細(xì)胞分析】單細(xì)胞數(shù)據(jù)整合分析哪家強(qiáng)？ -
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組之cellranger探索——1.安裝
實(shí)驗(yàn)室新服務(wù)器需要安裝cellranger，發(fā)現(xiàn)最新版（3.1.0）與舊版（1.2.0）有點(diǎn)差別，故整理流程如下： 1. 下載安裝 1.1下載地...
-
實(shí)驗(yàn)記錄2：Cellranger整理fastq數(shù)據(jù)為表達(dá)矩陣在分析單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)前，我們需要將原始的fastq測(cè)序文件轉(zhuǎn)化成我們可讀的數(shù)據(jù)，最好的方法是將數(shù)據(jù)整理為基因-細(xì)胞表達(dá)矩陣，如此一來(lái)后續(xù)的...
{var%20f='http://v.t.sina.com.cn/share/share.php?appkey=1881139527',u=z||d.location,p=['&url=',e(u),'&title=',e(t||d.title),'&source=',e(r),'&sourceUrl=',e(l),'&content=',c||'gb2312','&pic=',e(p||'')].join('');function%20a(){if(!window.open([f,p].join(''),'mb',['toolbar=0,status=0,resizable=1,width=440,height=430,left=',(s.width-440)/2,',top=',(s.height-430)/2].join('')))u.href=[f,p].join('');};if(/Firefox/.test(navigator.userAgent))setTimeout(a,0);else%20a();})(screen,document,encodeURIComponent,'','','https://upload.jianshu.io/collections/images/1807371/timg.jpg', '推薦專題《單細(xì)胞測(cè)序》（ 分享自 @簡(jiǎn)書 ）','http://www.itdecent.cn/c/cbc795ebc276?utm_campaign=maleskine&utm_content=collection&utm_medium=reader_share&utm_source=weibo','頁(yè)面編碼gb2312|utf-8默認(rèn)gb2312'));){kind=link}