WGCNA 分析確定重要模塊之后，如何找模塊內(nèi)的hubgene？ 想找hubgene,必須先理解其概念：網(wǎng)絡(luò)中處于核心位置的點(diǎn)（基因）。在WGC...
投稿
收錄了116篇文章 · 37人關(guān)注
-
2021-08-19WGCNA確定目標(biāo)模塊后如何找模塊內(nèi)的hubgene
-
WGCNA分析教程五 | [更新版]一邊學(xué)習(xí)，一邊總結(jié)，一邊分享！ 往期WGCNA分析教程 WGCNA分析 | 全流程分析代碼 | 代碼一[https://mp.weixin.qq...
-
轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析—Salmon定量salmon是一款不基于比對而直接對基因進(jìn)行定量的工具，適用于轉(zhuǎn)錄組、宏基因組等分析。其優(yōu)勢是： 定量時(shí)考慮到不同樣品中基因長度的改變（比如不同...
-
轉(zhuǎn)錄組有參分析之STAR比對及可變剪切
轉(zhuǎn)錄組有參分析之STAR比對及可變剪切 STAR比對的特點(diǎn)： 速度快 準(zhǔn)確度高 3'reads soft clip genomeLoad Loa...
-
【R畫圖學(xué)習(xí)22.1】進(jìn)化樹和氣泡組合圖今天學(xué)習(xí)繪制下面這個(gè)paper里面的一個(gè)圖。 從圖中，可以看出，圖片分成2個(gè)部分，左邊是進(jìn)化樹，右邊是類似氣泡圖。 下面我們用一組簡單的文件進(jìn)行...
-
用小餅圖代替點(diǎn)圖里的點(diǎn)0.起因 最近在群里看到一個(gè)圖，棒棒糖圖的點(diǎn)用餅圖代替了。 然后又看到一個(gè)文章里，用餅圖代替了富集分析的點(diǎn)圖，妙啊~ 這個(gè)地球上有什么漂亮的圖能...
-
nohup中怎么用 for/for 中怎么用nohup
nohup sh -c '命令行' & nohup sh -c 'for i in *sra; do fasterq-dump --split-...
-
轉(zhuǎn)錄組比對番外篇：aligner 與 mapping 區(qū)別
導(dǎo)讀 考慮到在轉(zhuǎn)錄組比對時(shí)，有許多軟件可以使用，但很少有介紹它們之間的差別。因此，本文主要介紹 STAR, KALLISTO, SALMON 之...
-
一文理清常見的基因富集分析
前言 對于很多小伙伴來說，剛?cè)胧稚艜r(shí)接觸最多的就是差異分析，即在基因組層面可以算突變率差異，轉(zhuǎn)錄組層面可以算基因表達(dá)水平差異，表觀組可以觀察甲...
-
RNA seq上游分析（簡潔版）
環(huán)境配置 質(zhì)檢 去接頭 比對 得到count值 最終會在目標(biāo)文件夾下面獲得兩個(gè)文件，counts.txt和counts.txt.summary。...
{var%20f='http://v.t.sina.com.cn/share/share.php?appkey=1881139527',u=z||d.location,p=['&url=',e(u),'&title=',e(t||d.title),'&source=',e(r),'&sourceUrl=',e(l),'&content=',c||'gb2312','&pic=',e(p||'')].join('');function%20a(){if(!window.open([f,p].join(''),'mb',['toolbar=0,status=0,resizable=1,width=440,height=430,left=',(s.width-440)/2,',top=',(s.height-430)/2].join('')))u.href=[f,p].join('');};if(/Firefox/.test(navigator.userAgent))setTimeout(a,0);else%20a();})(screen,document,encodeURIComponent,'','','https://upload.jianshu.io/collections/images/1781815/1559867262.jpg', '推薦專題《RNA-seq》（ 分享自 @簡書 ）','http://www.itdecent.cn/c/cfa63caa24ca?utm_campaign=maleskine&utm_content=collection&utm_medium=reader_share&utm_source=weibo','頁面編碼gb2312|utf-8默認(rèn)gb2312'));){kind=link}