這是我根據(jù)之前的WGS系列和GATK4實踐文章進行重新梳理之后確定下來的分析流程，這是一個WGS的最佳實踐，它基于GATK4和我的實際經(jīng)驗，稍作...
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GATK4全基因組數(shù)據(jù)分析最佳實踐,我以這篇文章為標志,終結(jié)當前WGS系列數(shù)據(jù)分析的流程主體問題 | 完全代碼 -
GATK4.0和全基因組數(shù)據(jù)分析實踐（上）前言 在前面的一系列WGS文章中，我講述了很多基因數(shù)據(jù)分析的來龍去脈，雖然許多同學(xué)覺得很有幫助，但是卻缺了一個重要的環(huán)節(jié)——沒有提供實際可用的數(shù)...
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從零開始完整學(xué)習(xí)全基因組測序（WGS）數(shù)據(jù)分析：第4節(jié) 構(gòu)建WGS主流程這篇文章很長，超過1萬字，是本系列中最重要的一篇，因為我并非只是在簡單地告訴大家?guī)讞l硬邦邦的操作命令。對于新手而言不建議碎片時間閱讀，對于有一定...
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從零開始完整學(xué)習(xí)全基因組測序（WGS）數(shù)據(jù)分析：第2節(jié) FASTA和FASTQ在WGS數(shù)據(jù)的分析過程中，我們會接觸到許多生物信息學(xué)/基因組學(xué)領(lǐng)域所特有的數(shù)據(jù)文件和它們特殊的格式，在這一節(jié)中將要介紹的FASTA和FASTQ便...
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從零開始完整學(xué)習(xí)全基因組測序（WGS）數(shù)據(jù)分析：第1節(jié) DNA測序技術(shù)前言 基因測序已是時下熱門，目前除了華大基因之外，其他分布于全中國的大型測序平臺（HiSeq X 10）還有約10個，每個每年大概能完成1.8萬...
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