IBS是指兩個(gè)個(gè)體中共有的等位基因序列相同，IBS的遺傳距離可以衡量樣本間的相似性，評(píng)價(jià)其親緣關(guān)系。
投稿
收錄了9篇文章 · 7人關(guān)注
-
IBS距離矩陣
-
曼哈頓圖的繪制
在生信分析中，我們都需要借助曼哈頓圖來可視化Fst、iHS等選擇信號(hào)的分析結(jié)果，那么，如何繪制曼哈頓圖呢？ 我們這里使用R語言中的qqman包來...
-
群體遺傳研究——變異注釋--snpEff和ANNOVARsnpEff snpEff4.0軟件之后默認(rèn)下載安裝所有動(dòng)物的庫（ensembl的庫） 但是ensembl的庫有個(gè)缺點(diǎn)就是注釋出來的基因是ens...
-
2021.11.19 | 群體遺傳結(jié)構(gòu)、PCA、進(jìn)化樹
常見的群體結(jié)構(gòu)的分析方法有admixture分析、系統(tǒng)發(fā)生數(shù)分析以及主成分分析等。 1、admixture分析 1）R語言繪圖 admixtur...
-
群體遺傳變異——拷貝數(shù)變異分析基因組發(fā)生重排而導(dǎo)致的,一般指長度1 kb 以上的基因組片段的拷貝數(shù)增加或者減少, 主要表現(xiàn)為亞顯微水平的重復(fù)或者缺失。因此稱為“微”缺失/重復(fù)...
-
群體適應(yīng)性分析——選擇信號(hào)●選擇信號(hào)：生物在自然選擇或人工選擇過程中，由于選擇作用在基因組上留下的遺傳多態(tài)性降低、連鎖不平衡等選擇印記?！襁x擇性清除（selective ...
-
動(dòng)物馴化及群體歷史研究●與馴化相關(guān)的研究熱點(diǎn)主要集中在：家養(yǎng)動(dòng)物何時(shí)何地被馴化？馴化途徑是什么？馴化表型是什么？與馴化表型相關(guān)的基因有哪些？家養(yǎng)動(dòng)物馴化地點(diǎn)大致主要集...
-
主成分分析
數(shù)據(jù)過濾質(zhì)控之后 PCA分析（gcta） 利用R繪圖
-
群體進(jìn)化分析--基因流及群體歷史分析——我愿稱之為史上最全基因流（也稱基因遷移）是指從一個(gè)物種的一個(gè)種群向另一個(gè)種群引入新的遺傳物質(zhì)，從而改變?nèi)后w“基因庫”的組成。通過基因交流向群體中引入新的等位基因，...
{var%20f='http://v.t.sina.com.cn/share/share.php?appkey=1881139527',u=z||d.location,p=['&url=',e(u),'&title=',e(t||d.title),'&source=',e(r),'&sourceUrl=',e(l),'&content=',c||'gb2312','&pic=',e(p||'')].join('');function%20a(){if(!window.open([f,p].join(''),'mb',['toolbar=0,status=0,resizable=1,width=440,height=430,left=',(s.width-440)/2,',top=',(s.height-430)/2].join('')))u.href=[f,p].join('');};if(/Firefox/.test(navigator.userAgent))setTimeout(a,0);else%20a();})(screen,document,encodeURIComponent,'','','https://upload.jianshu.io/collections/images/1999339/IBS.png', '推薦專題《基因組分析》（ 分享自 @簡書 ）','http://www.itdecent.cn/c/dac73fa2dfed?utm_campaign=maleskine&utm_content=collection&utm_medium=reader_share&utm_source=weibo','頁面編碼gb2312|utf-8默認(rèn)gb2312'));){kind=link}