Charpter 15 Advanced Command Line 背景 在Linux下的數(shù)據(jù)分析從質(zhì)控到比對(duì)到后續(xù)分析等，每一步都需要獨(dú)立的軟...
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Biostar_handbook||charpter 14. SAM格式及SAMTOOLS操作
Charpter_14 Sequence Alignment Maps(SAM) SAM文件是由Tab(\t)分割，面向‘行’的文本格式文件，主...
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Biostar_handbook||charpter 13. 短序列比對(duì)BWA/Bowtie
Charpter_13 Short Read Aligners 背景 定義：Short read Aligners are commonly u...
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Biostar_handbook || Charpter 5. 本體論(Ontologies)
Ontology 概念： 個(gè)人理解就是生物信息學(xué)界對(duì)生物上的一些重要信息，如序列和基因信息 制定一個(gè)通用的標(biāo)準(zhǔn)化協(xié)議，對(duì)一些概念、信息進(jìn)行精準(zhǔn)的...
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Biostar_handbook||charpter 12. BLASTBLAST: basic local alignment search tool。包括：blastn, blastp, blastx, tbla...
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Biostar_handbook||charpter 10_11. 模式匹配_序列聯(lián)配
Charpter 10 Sequence Pattern 模式匹配 Sequence Pattern序列模式：A sequence patter...
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純二代測(cè)序從頭組裝基因組基因組組裝 基因組組裝一般分為三個(gè)層次，contig, scaffold和chromosomes. contig表示從大規(guī)模測(cè)序得到的短讀(re...
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2018-03-01What is BLAST:BLAST is a methodology to search few and short sequences a...
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biostar handbook(十)|如何進(jìn)行變異檢測(cè)什么是基因組變異 基因組變異是一個(gè)定義比較模糊的概念. 所謂的變異是相對(duì)于一個(gè)完美的“參考基因組”而言。但是其實(shí)完美的“參考基因組”并不存在，因...
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