今天跟大家分享的是2019年09月發(fā)表在Front Oncology(IF=4.14)雜志上的文章Screening and Identifyi...
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純生信4+膀胱癌免疫微環(huán)境思路分享
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R 數(shù)據(jù)可視化 01 | 聚類熱圖一. 示例數(shù)據(jù)準(zhǔn)備 下載：鏈接：https://pan.baidu.com/s/1_b8swSkWDqIHZi6UwKaspA提取碼：pll7 ...
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enrichplot||基因富集結(jié)果可視化解決方案enrichplot包實(shí)現(xiàn)了幾種可視化方法來(lái)幫助解釋富集結(jié)果。它支持從DOSE (Yu et al. 2015)、clusterProfiler...
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UCSCXenaShiny實(shí)現(xiàn)基因表達(dá)的Pancer(泛癌）展示UCSCXenaShiny包由我和幾位小伙伴共同開(kāi)發(fā)，如果對(duì)您有幫助請(qǐng)致謝我們，并引用我們的R包，有什么問(wèn)題也可以給我們反饋。網(wǎng)址為https:...
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從GEO數(shù)據(jù)下載到limma差異分析，再到topGO富集分析一個(gè)失敗案例，不要點(diǎn)進(jìn)來(lái) GSE2034 topGO 1. DEG 1.1 下載GEO數(shù)據(jù) 1.2 表達(dá)矩陣 before: after: 1....
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R實(shí)戰(zhàn) | TCGA數(shù)據(jù)挖掘復(fù)現(xiàn)--BRCA篇本文寫于觀看生信技能樹(shù)公眾號(hào)（vx: biotrainee）的七步走純R代碼通過(guò)數(shù)據(jù)挖掘復(fù)現(xiàn)一篇實(shí)驗(yàn)文章（第1到6步）[https://mp.w...
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腫瘤免疫浸潤(rùn)分析工具匯總-數(shù)據(jù)挖掘新高度
2018年腫瘤免都疫榮獲諾獎(jiǎng)，成為一大熱點(diǎn)。咱有些小伙伴的數(shù)據(jù)庫(kù)挖掘卻一萬(wàn)年停留在那些被玩壞了的套路上，比如像這樣做一個(gè)GEO的差異分析，就放上...
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生信學(xué)習(xí)筆記：使用SNP data做基因滲入分析 (3)
距離上次更新這個(gè)專題后，該教程的原作者更新了一下原教程，使用了一個(gè)新的，非常好用的工具，Dsuite進(jìn)行基因滲入分析，這期的推文就和大家一起回顧...
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TCGA數(shù)據(jù)挖掘三：針對(duì)不同因素和不同方法的生存分析加載并處理數(shù)據(jù) 針對(duì)臨床資料某一因素，如年齡，性別等進(jìn)行生存分析，并畫圖 針對(duì)基因的生存分析：方法一：挑選感興趣的基因做生存分析 針對(duì)基因的生存...
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一個(gè)不咋成功的3d從芯片文件讀取，RMA處理后，主要繪制兩個(gè)圖，pca3d和熱圖。 文章來(lái)源： 《Integrated Analysis of Copy Numb...
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