10X genomics的基本原理 在這個(gè)教程中，主要將分析 10X Genomics 免費(fèi)提供的外周血單核細(xì)胞 (PBMC) 數(shù)據(jù)集。在 Il...
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單細(xì)胞分析(一）——seurat包單個(gè)樣本處理 -
多組差異基因富集分析結(jié)果聚類 | 獲得共表達(dá)term的富集圖本教程問題：1.mmGO.rdata文件的制作，是否不需要這一步，更改一下腳本即可實(shí)現(xiàn)呢？2.這樣的圖形美化，目前的圖還不是很滿意，需要進(jìn)行美化...
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SCpubr包：讓你的單細(xì)胞測(cè)序分析圖表更加高級(jí)好看，代碼實(shí)操分享該R包由國(guó)外友人Enblacar完成，目前處于預(yù)印本階段，旨在提供一種簡(jiǎn)化的方式，為已知的單細(xì)胞可視化生成可發(fā)布的圖形。與“審美愉悅”一詞一樣主...
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R實(shí)戰(zhàn) | 森林圖繪制R實(shí)戰(zhàn) | 森林圖繪制 回答一下R繪圖實(shí)戰(zhàn)|GSEA富集分析圖 - 知乎 (zhihu.com)[https://zhuanlan.zhihu....
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一篇數(shù)據(jù)挖掘文章的圖表復(fù)現(xiàn)-10.文章 文章標(biāo)題：Characterization of an endoplasmic reticulum stress‐related si...
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【塊】Cibersort.R計(jì)算22種免疫細(xì)胞浸潤(rùn)分?jǐn)?shù)綜合簡(jiǎn)書作者們的文章以及自己操作，綜合整理如下，以備后面使用。有問題歡迎交流Robust enumeration of cell subsets...
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ggplot2繪制GO富集分析柱狀圖1.使用clusterProfiler包進(jìn)行GO富集分析使用clusterProfiler的enrichGO函數(shù)來(lái)獲取GO分析 gene就是差異...
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GSVA + limma進(jìn)行差異通路分析
一般我們做GSEA都是先進(jìn)行差異基因分析，然后取差異倍數(shù)排序結(jié)果進(jìn)行GSEA。但如果你沒有條件進(jìn)行差異基因分析也可以進(jìn)行GSEA，這就是ssGS...
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跟著Gut學(xué)畫圖：R語(yǔ)言ggtree包畫弦圖的簡(jiǎn)單小例子今天的推文內(nèi)容是模仿論文 Aberrant gut microbiota alters host metabolome and impacts ...
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R語(yǔ)言ggplot2做云雨圖的簡(jiǎn)單小例子云雨圖的樣子如下 是一半的小提琴圖加散點(diǎn)圖的組合，看起來(lái)有些像云朵加雨滴的形式，所以得名云雨圖，主要的作用還是用來(lái)展示數(shù)據(jù)的分布情況 之前看到過...
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