將原始fq文件通過FastQC-align-samtools||GATK等流程最終得到vcf文件,也就是記錄某些位點(diǎn)變異的文本文件。但只是通過看...
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將原始fq文件通過FastQC-align-samtools||GATK等流程最終得到vcf文件,也就是記錄某些位點(diǎn)變異的文本文件。但只是通過看...
linux基本命令 第六章 Linux文件與目錄管理 極客學(xué)院服務(wù)器 高通量相關(guān)基礎(chǔ)知識 生信一百講 1、 Anaconda Anaconda是...
使用工具GATK4。GATK基礎(chǔ)RNA-seq分析完整版BSR參考GATK官方RNA-seq calling流程最新版的BSR分析流程流程參考W...
劉小澤寫于18.7.17所有的數(shù)據(jù),一旦要找變異位點(diǎn)信息,就離不開VCF。豆豆也是在寫一個(gè)重測序的操作流程,遇到了VCF文本,之前也是沒有了解過...
劉小澤寫于18.12.2這個(gè)周末做了不少事,參加了P4 China精準(zhǔn)醫(yī)療會議,第一次參加這種國際性會議,長了不少見識,同時(shí)帶回來很厚一摞“背景...
劉小澤寫于2020.3.13推薦一本書:《Perl One-liners:130 Programs That Get Things Done》P...
原創(chuàng):熊+jimmy+SX 生信技能樹 主要是awk/grep/sed這三駕馬車,加上vi這個(gè)神器,最后輔助一些小工具,包括 wc,cat,di...
簡介 文章較長,點(diǎn)擊直達(dá)我的博客,瀏覽效果更好。本文內(nèi)容基本是來源于STHDA,這是一份十分詳細(xì)的ggplot2使用指南,因此我將其翻譯成中文,...
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1、對變量取值 2、求字符串的長度 3、提取位置3到最后的字符 4、從位置3,開始提取5個(gè)字符 5、從左邊開始,刪除最短匹配r 6、從左邊開始,...