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服務(wù)器運(yùn)行中我正在努力完成

轉(zhuǎn)錄組

DAY5學(xué)習(xí)內(nèi)容：過(guò)濾和比對(duì) 過(guò)濾 通過(guò)DAY4_fastqc結(jié)果，我們開(kāi)始對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行過(guò)濾，主要是去除接頭和低質(zhì)量堿基，一般使用兩種軟件可以完成...

數(shù)據(jù)過(guò)濾 簡(jiǎn)介： 目的去掉低質(zhì)量的堿基或接頭，一般使用兩款軟件：trim_galore和trimmomatic,他們的去除是從不合格的位置往后全...

開(kāi)始忙碌起來(lái)，作業(yè)可能沒(méi)法扯那么多閑話了。 數(shù)據(jù)質(zhì)控 昨天完成了數(shù)據(jù)格式的轉(zhuǎn)換，接下來(lái)就可以對(duì)得到的fastq文件進(jìn)行處理啦。由于數(shù)據(jù)的問(wèn)題，本...

今天將會(huì)用到第二天建立的rnaseq環(huán)境及對(duì)應(yīng)文件路徑和Day3下載好的.sra數(shù)據(jù) 今天主要學(xué)習(xí)內(nèi)容是配置相關(guān)軟件環(huán)境，開(kāi)始數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換，質(zhì)量控制...

軟件環(huán)境 數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換： 將SRA轉(zhuǎn)變?yōu)閒q格式。用到軟件fastq-dump,它屬于sratools工具包中的一個(gè)。 數(shù)據(jù)質(zhì)控：檢測(cè)原始數(shù)據(jù)質(zhì)量如...

閑言碎語(yǔ) 從今天開(kāi)始轉(zhuǎn)錄組學(xué)習(xí)進(jìn)入正題啦。要重現(xiàn)的文章是 RNA-Seq Transcriptome Profiling Identifies ...

端午安康 今天轉(zhuǎn)錄學(xué)習(xí)第三天，開(kāi)始進(jìn)入實(shí)戰(zhàn)的第一步----數(shù)據(jù)查找和下載 今天要被自己蠢哭了，自己挖坑自己跳，還給自己埋了2個(gè)多小時(shí)，真的不夸張...