有許多不同的統(tǒng)計(jì)量可以衡量差異選擇的區(qū)域或基因滲入障礙的區(qū)域。這里介紹常用的四個(gè)統(tǒng)計(jì)量的計(jì)算： pi, 衡量遺傳多樣性 Fst, 衡量群體分化程...
投稿
收錄了24篇文章 · 368人關(guān)注
-
pi, Fst, dxy, fd的計(jì)算
-
群體遺傳筆記（一）：群體間選擇信號(hào)的檢測(cè)及GO注釋從獲取下機(jī)數(shù)據(jù)做質(zhì)控、比對(duì)，到calling snp獲得vcf文件這一步，網(wǎng)上已經(jīng)有非常詳細(xì)的教程，有GATK4.0和全基因組數(shù)據(jù)分析實(shí)踐（上）...
-
重復(fù)一篇文獻(xiàn)的GWAS（一）：基因型數(shù)據(jù)整理文獻(xiàn)：A new regulator of seed size control in Arabidopsis identified by a g...
-
群體遺傳學(xué)-選擇清除分析一、中性學(xué)說(shuō) 分子水平上，生物的演化或物種的進(jìn)化并不是自然選擇引起的，而是由中性/近中性的突變等位基因經(jīng)過(guò)遺傳漂變引起的，從而形成分子水平上的進(jìn)...
-
我的GWAS學(xué)習(xí)筆記上個(gè)月中旬，出于對(duì)GWAS的好奇，我參加了一個(gè)培訓(xùn)班，之后又花了一周的時(shí)間來(lái)整理聽(tīng)課筆記，感覺(jué)現(xiàn)在對(duì)GWAS已經(jīng)有了一個(gè)比較全面的認(rèn)識(shí)。 在ca...
-
群體遺傳學(xué)的那些事兒（一）
這周開(kāi)始會(huì)陸續(xù)每周和大家分享一些和群體基因組學(xué)相關(guān)的知識(shí)（嗯，我又開(kāi)始挖坑了）。本次推文先不進(jìn)行具體知識(shí)的講解，先從比較泛的角度去介紹一下群體基...
-
群體遺傳學(xué)的那些事兒（二）
每周和你一起學(xué)習(xí)一些群體遺傳的知識(shí)，每周和你一起進(jìn)步，歡迎回來(lái)！上一回介紹完基本的群體遺傳學(xué)的概念后，這周會(huì)給大家?guī)?lái)一些關(guān)于等位基因和基因型頻...
-
LD衰減圖的理解與應(yīng)用
在群體遺傳學(xué)研究中，LD連鎖不平衡分析是最常見(jiàn)的分析內(nèi)容，也是關(guān)聯(lián)分析的基礎(chǔ)。如何正確理解并且進(jìn)行相關(guān)的LD連鎖不平衡分析是群體遺傳中很基本的一...
-
Fst的計(jì)算原理與實(shí)戰(zhàn)
概念回顧 Fst：群體間遺傳分化指數(shù)，是種群分化和遺傳距離的一種衡量方法，分化指數(shù)越大，差異越大。適用于亞群體間多樣性的比較。 用于衡量種群分化...
-
Structure圖的構(gòu)建與理解
介紹 什么是structure圖？ 如果你有看過(guò)群體遺傳相關(guān)的文章，你對(duì)它肯定不會(huì)陌生。對(duì)那些還沒(méi)有接觸過(guò)的同學(xué)，那就直接上圖吧： 上圖是選取于...
{var%20f='http://v.t.sina.com.cn/share/share.php?appkey=1881139527',u=z||d.location,p=['&url=',e(u),'&title=',e(t||d.title),'&source=',e(r),'&sourceUrl=',e(l),'&content=',c||'gb2312','&pic=',e(p||'')].join('');function%20a(){if(!window.open([f,p].join(''),'mb',['toolbar=0,status=0,resizable=1,width=440,height=430,left=',(s.width-440)/2,',top=',(s.height-430)/2].join('')))u.href=[f,p].join('');};if(/Firefox/.test(navigator.userAgent))setTimeout(a,0);else%20a();})(screen,document,encodeURIComponent,'','','https://upload.jianshu.io/collections/images/1652382/dzw_qt_t6.jpg', '推薦專(zhuān)題《群體遺傳學(xué)習(xí)小組》（ 分享自 @簡(jiǎn)書(shū) ）','http://www.itdecent.cn/c/ff811f9ef696?utm_campaign=maleskine&utm_content=collection&utm_medium=reader_share&utm_source=weibo','頁(yè)面編碼gb2312|utf-8默認(rèn)gb2312'));){kind=link}