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染色體區(qū)段6p21.31在哪？6p21.31這種表示方式在人類遺傳學中用得比較多。在參考基因組出來之前，人們通過做實驗染色的方法將染色體染成很多段（就是那種很經(jīng)典的黑白灰分段...
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關于人類參考基因組的一些認識1. 如何選擇參考基因組？——李恒2017年年底博客 1.1 三種選擇 如果比對到GRCh37/hg19，使用： ftp://ftp-trace...
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Gencode數(shù)據(jù)庫1. Gencode 官網(wǎng)：https://www.gencodegenes.org/ 1.1 The GENCODE Project: Enc...
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重復一篇文獻的GWAS（二）：用GEMMA跑GWAS上一篇寫的是：重復一篇文獻的GWAS（一）：基因型數(shù)據(jù)整理這一篇主要講GWAS的核心流程和畫圖。 軟件使用參考：使用GEMMA進行復雜性狀全基因...
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重復一篇文獻的GWAS（一）：基因型數(shù)據(jù)整理文獻：A new regulator of seed size control in Arabidopsis identified by a g...
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我的GWAS學習筆記上個月中旬，出于對GWAS的好奇，我參加了一個培訓班，之后又花了一周的時間來整理聽課筆記，感覺現(xiàn)在對GWAS已經(jīng)有了一個比較全面的認識。 在ca...
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基因型填充之后如何過濾比如 個體分型率 < 90% 某一個樣本測出來的標記小于全部標記的90% 標記分型率 < 90% 某一個標記只在小于90%的樣本中存在 最小等位...
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用Beagle做基因型填充（Imputation）在學習基因型填充之前需要了解一下什么是Phasing（基因定相、單倍體分型），主要是參考公眾號堿基礦工中的一篇文章：人類基因組的Phasing原...
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學一點兒基因組組裝1.下機數(shù)據(jù)質量控制 主要是針對低質量的reads和含有adapter的reads，我事先并不知道adapter序列，所以就只過濾了低質量的re...
