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群體進化選擇消除分析要做選擇性消除分析，首先就要把如下的理論記住熟記于心。 中性進化假說： 分子水平上，生物的演化或物種的進化并不是自然選擇引起的，而是由中性/近中...
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基因流分析——Treemix基本概念： 基因流（也稱基因遷移） 是指從一個物種的一個種群向另一個種群引入新的遺傳物質(zhì)，從而改變?nèi)后w“基因庫”的組成。通過基因交流向群體中引入...
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基因流分析——D統(tǒng)計基本概念 基因滲入(introgression)： 是在遺傳學中，指兩個基因庫間的基因流動，通常是經(jīng)過種間雜交產(chǎn)生?；驖B入是一個長期的過程，它...
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群體遺傳學統(tǒng)計指標——種群核苷酸多樣性
理論 種群核苷酸多樣性，顧名思義指的就是核苷酸多樣性，值越大說明核苷酸多樣性越高。通常用于衡量群體內(nèi)的核苷酸多樣性，也可以用來推演進化關(guān)系。計算...
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群體結(jié)構(gòu)——系統(tǒng)發(fā)育樹的構(gòu)建最近雜事真的非常的滿，終于找到時間更新一下。。。。 通過上一篇文章的介紹，系統(tǒng)發(fā)育樹的基本概念[http://www.itdecent.cn/...
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基因組比對結(jié)果的可視化IGV（Integrative Genomics Viewer）是一款本地使用的基因組可視化神器，不管你用何種系統(tǒng)基本上都可找到對應的安裝包，方...
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群體結(jié)構(gòu)——Structure堆疊圖詳細畫法
基本概念 基迪奧有篇文章寫得非常的簡單明了，我這里就不再贅述，大家移步去搞清楚基本知識。 群體結(jié)構(gòu)圖形——structure堆疊圖[https:...
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群體結(jié)構(gòu)——PCA分析概念 PCA（principal components analysis）即主成分分析。主成分分析也稱主分量分析，旨在利用降維的思想，把多指標轉(zhuǎn)...
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群體遺傳學親緣關(guān)系分析
親緣關(guān)系分析實操 前期準備 給標記加上ID SNP data通常都是以VCF格式文件呈現(xiàn)，拿到VCF文件的第一件事情就是添加各個SNP位點的ID...
