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bulk RNA-Seq（9）富集分析歡迎關(guān)注Bioinfor 生信云！ 這一期我們來講講富集分析。 構(gòu)建OrgDB OrgDB是bioconductor中存儲不同數(shù)據(jù)庫基因ID之間...
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bulk RNA-Seq（8）差異表達分析可視化歡迎關(guān)注Bioinfor 生信云微信公眾號！ 上一期我們講了樣本相關(guān)性分析的一些可視化，這一期我們來做差異分析的熱圖和火山圖。 火山圖 火山圖（...
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bulk RNA-Seq（7）樣本相關(guān)性、聚類、PCA分析歡迎關(guān)注Bioinfor 生信云微信公眾號！ 讀取三張表 樣本相關(guān)性 相關(guān)性分析correlationR語言的cor函數(shù)，可以計算變量之間的相關(guān)...
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bulk RNA-Seq （6）數(shù)據(jù)挖掘的準備歡迎關(guān)注Bioinfor 生信云 微信公眾號！ 我們做完了上游的基礎(chǔ)分析之后，接下來就是數(shù)據(jù)挖掘了。我們先準備數(shù)據(jù)挖掘的三張表。 表達矩陣（ge...
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bulk RNA-Seq （5）差異分析
歡迎關(guān)注Bioinfor 生信云 微信公眾號！ 差異表達分析用于比較兩個樣本中同一個基因的的表達量是否存在差異。用到的統(tǒng)計方法是假設(shè)檢驗，所以樣...
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bulk RNA-Seq （4）合并表達矩陣
歡迎關(guān)注Bioinfor 生信云 微信公眾號！ 上一步定量，我們是對每一個樣本進行的，現(xiàn)在需要將它合并到一個矩陣。這里通過一個腳本merge_t...
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bulk RNA-Seq （3）表達定量歡迎關(guān)注Bioinfor 生信云微信公眾號！ 上一篇推文講了bulk RNA-Seq 的比對到參考基因組部分，接下來就是基因表達定量了。計算表達...
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bulk RNA-Seq （2）比對到參考基因組歡迎關(guān)注Bioinfor 生信云！ 上一篇推文講了bulk RNA-Seq 的數(shù)據(jù)清洗部分，接下來就是將清洗后的數(shù)據(jù)比對到參考基因組上（有參）。...
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bulk RNA-Seq (1) 數(shù)據(jù)清洗歡迎關(guān)注bioinfor 生信云微信公眾號！ 今天我們來講一講bulk轉(zhuǎn)錄組測序的數(shù)據(jù)清洗部分。 RNA-Seq是技術(shù)相對更成熟，應用最廣泛，最...
