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全基因組復制分析（WGD）全基因組復制 全基因組復制事件是物種的染色體由于某種原因整體復制加倍的事件； 大多數(shù)被子植物都經歷過多倍化事件； 物種在自然選擇壓力較大的時候可...
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正選擇分析中性理論 中性理論認為，我們今天觀察到的遺傳變異——無論是種內多態(tài)性還是種間分歧，均不取決于自然選擇所驅動的有利突變的固定，而是取決于那些中性突...
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jcvi(MCscan Python 版) 共線性分析jcvi網址：MCscan (Python version) · tanghaibao/jcvi Wiki · GitHub[https://g...
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MCScanX共線性分析共線性 共線性片段是指一個同一個物種內部或者兩個物種之間，由基因組復制、染色體復制、大片段復制以及物種分化而產生的大片段同源現(xiàn)象。同源片段內部基...
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基因家族的收縮與擴張基因家族指來自諸多物種的MRCA（Most Recent Common Ancestor，最近共同祖先）的同一個始祖基因演化而來的一組基因。 研...
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看完這篇推送的，據(jù)說都學會了分化時間計算？！分子鐘假說 基因序列中密碼子隨著時間的推移以幾乎恒定的比例相互替換，即具有恒定的演化速率，兩個物種之間的遺傳距離將與物種的分化時間成正比。我們通...
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一文學懂進化樹原理進化樹概念 系統(tǒng)發(fā)育樹（phylogenetic tree），也叫進化樹，是物種間、基因間、群體間乃至個體間譜系關系的一種表現(xiàn)形式。 Node：...
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使用ITOL美化進化樹iTOL（Interactive Tree Of Life）是一款在線進化樹美化軟件，功能強大，可以展示各種數(shù)據(jù)。網址：https://itol...
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基于orthofinder 結果構建物種樹
串聯(lián)法 orthofinder 已經生成好單拷貝基因串聯(lián)的序列，可以直接使用。找到orthofinder 已經生成好單拷貝基因串聯(lián)的序列，Spe...
