疾病負(fù)擔(dān)研究(GBD)-如何繪制GBD相關(guān)性圖 - 草稿

本篇是GBD相關(guān)的第5篇推文,接著上一次的推文,我們同樣來看那個范例文章,圖2-4是一個比較簡單的條形圖,這里我們就不展示了。我們來看看圖5中的B與C圖是如何做出來的


我們首先來看圖B如何繪制,可以看到這個是相關(guān)性分析的散點圖,圖B是ASR與EAPC的散點圖,圖中圓圈大小表示1990的絕對病例數(shù)。我們可以在它的基礎(chǔ)上直接把ASDR與ASIR與EAPC的相關(guān)性畫在一張圖中。繪制之前我們需要得到3個數(shù)據(jù)結(jié)果:ASR、EAPC以及發(fā)病例數(shù)。


我們讀取數(shù)據(jù)


我們首先獲取ASIR以及發(fā)病例數(shù)


計算EAPC數(shù)據(jù)


然后將3者變量合成在一個數(shù)據(jù)集中


同樣的,我們獲取ASDR以及死亡病例數(shù)


計算死亡率的EAPC數(shù)據(jù)


然后將3者變量合成在一個數(shù)據(jù)集中


合并發(fā)病率及死亡率數(shù)據(jù)集后繪制圖像


最后得到的圖形如下:


計算兩張圖的對應(yīng)pearson系數(shù)


得到的pearson系數(shù)如下


最后大家用AI中處理圖像再加上pearson系數(shù)即可。

接下來我們繪制圖B,繪制之前我們需要得到3個數(shù)據(jù)結(jié)果:HDI、EAPC以及發(fā)病例數(shù)。

HDI可以從官網(wǎng)下載http://hdr.undp.org/en/composite/HDI


我們將其整理成csv表格后


然后我們讀取HDI數(shù)據(jù)


獲取2019年絕對發(fā)病數(shù)


計算EAPC


合并三者數(shù)據(jù)


隨后我們再獲取死亡率數(shù)據(jù)

獲取2019絕對死亡例數(shù)


計算死亡率的EAPC


合并三者數(shù)據(jù)


最后合并發(fā)病率以及死亡率的數(shù)據(jù)集后作圖


得到的圖形如下:


最后計算2張圖的pearson相關(guān)系數(shù)


最后同樣用AI軟件修飾圖形,并將相關(guān)系數(shù)加入到圖像中即可。

這樣相關(guān)性系數(shù)就可以完成了。


大家可以根據(jù)上述代碼進行實操,如需要上述代碼,請關(guān)注gongzhonghao——小明學(xué)習(xí)室,回復(fù)關(guān)鍵詞“GBD”即可獲取上述代碼

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