miniconda3及加速器mamba安裝
話說，conda是個好東西，譬如當(dāng)沒有權(quán)限又想安裝軟件的時候，再譬如我想安裝個舊版本的R，手動編譯經(jīng)常有各種依賴問題。這些，conda都能輕松解決，本期我們的內(nèi)容：
miniconda的安裝及鏡像配置
如何用conda安裝指定版本的R
mamba加速器的安裝
miniconda3安裝
下載安裝腳本，并運行：
wget https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
接下來按照提示走，先回車繼續(xù)，然后一直按空格翻頁，直到出現(xiàn)以下選項，輸入yes后回車:
輸入安裝路徑：
接下來會提示是否需要啟動時自動激活conda，由于我不需要，所以我這里選擇no，回車以后即安裝結(jié)束。
修改conda環(huán)境變量
cp ~/.bashrc ~/.bashrc_bak # 修改環(huán)境變量前最好先備份一下，以免出現(xiàn)問題
echo 'export PATH=/root/install/miniconda3/bin:$PATH' >> ~/.bashrc
source ~/.bashrc
查看conda信息：
接下來我們來配置國內(nèi)鏡像源，這里我們加上部分清華源：
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/r/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/pytorch/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/biobakery/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --set show_channel_urls yes # 安裝軟件的時候顯示鏡像來源
查看添加的鏡像源：
conda config --get channels
其實以上就是對~/.condarc配置文件（內(nèi)容如下）的修改，我們也可以直接在此文件里面進(jìn)行修改。
安裝指定版本的R
配置完成，接下來我們介紹一下如何安裝指定版本的R:
創(chuàng)建一個新環(huán)境，并激活此環(huán)境：
conda create -n R_4.0.3
source activate R_4.0.3
安裝R
conda install r-base=4.0.3
conda deactivate # 退出此環(huán)境
conda env list # 查看當(dāng)前conda已安裝的環(huán)境
1719933924305.jpg
修改環(huán)境變量
echo 'export PATH=/root/install/miniconda3/envs/R_4.0.3/bin:$PATH' >> ~/.bashrc
source ~/.bashrc
R
安裝完成！
mamba加速器的安裝
安裝完conda之后強烈推薦再安裝一個mamba加速軟件（是真的加速，誰用誰知道?。。。?/p>
conda install mamba -n base
安裝后，之后使用只需要把conda命令換成mamba即可，例如剛剛安裝R那一步，你可以這樣寫：
mamba install r-base=4.0.3
miniconda3卸載
刪除安裝目錄即可
rm -rf /root/install/miniconda3 ~/.conda ~/.condarc
