- run.conf.ini文件中reference database一定要用blast所用的數(shù)據(jù)庫,否則會顯示key error。
- all_genes_with_categories_table.txt 中的phenazine的基因需要修改成phlA等基因,否則會顯示phlA的key error。
- 如果用自己構(gòu)建的.faa,就會出現(xiàn)KeyError: 'lepA_RS_GCF_000966285.1_6884336', 目前不知道如何解決。
2021-12-27 phenazine程序的修改
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- 本文參考文獻(xiàn)https://www.nature.com/articles/nprot.2016.095#mate...