一個(gè)做了10年基礎(chǔ)研究菜鳥(niǎo)的一點(diǎn)兒心得,希望對(duì)喜愛(ài)科研又受困于不能做出漂亮結(jié)果的菜鳥(niǎo)們有用。
首先,希望我直接給出試劑配制加多少毫升/微克組分,電泳、轉(zhuǎn)膜多大電流電壓跑多久的同學(xué)請(qǐng)繞道,因?yàn)槲遗懿煌牡鞍锥紩?huì)調(diào)試相應(yīng)條件,這是想做好Western的前提--不能死記硬背,墨守陳規(guī)!
下面是干貨:
1、蛋白樣準(zhǔn)備。
細(xì)胞組織裂解有條件一定要加蛋白酶和磷酸酶抑制劑以及PMSF,保證蛋白的完整。β巰基乙醇一定要加,尤其是有很多亞基的蛋白,只有把亞基間的二硫鍵破壞,才能得到你的抗體所檢測(cè)的蛋白多肽。
有條件一定要測(cè)定蛋白濃度,不要迷信于基于細(xì)胞計(jì)數(shù)+調(diào)內(nèi)參的Western,事實(shí)是在特定處理下,內(nèi)參的表達(dá)也會(huì)發(fā)生改變(例如PDGF-bb處理就會(huì)改變actin)。在這種情況下,只有用蛋白濃度計(jì)算得到的上樣量才是標(biāo)準(zhǔn)上樣量,才能進(jìn)行橫向比較。
測(cè)完濃度,計(jì)算得到相同上樣量所需體積后,一定要保證最后的跑膠樣品上樣體積和樣品中的離子濃度一樣(這是你跑出相同寬度完美條帶的必要條件)。我一般是蛋白樣品+loading,剩余的用裂解液補(bǔ)齊,marker也會(huì)補(bǔ)相應(yīng)的loading。最后總體積不要太大,<40都是可以的。
2、配膠
玻璃板一定要洗干凈,不然到時(shí)候膠不勻,跑出來(lái)波浪形的條帶也不奇怪。要想蛋白分得開(kāi),濃度就大一點(diǎn)。如果特別著急,temed是可以多加的,有時(shí)候多加1-5都是可以的。液封用異丙醇頁(yè)面比較整齊,乙醇也是可以的,液封的時(shí)候一定要慢,加的太猛會(huì)讓你的液面一言難盡。上層膠一般2-3厘米左右,反正比梳子長(zhǎng)一點(diǎn)就可以。
3、電泳
跑膠之前先用30V左右的小電壓跑3-5分鐘,讓膠里面的離子和電泳液的一致(重要的樣用新配的電泳液,不要?。I蠘影赐w積同離子濃度跑,marker也要加loading,否則最兩邊的樣品會(huì)跑歪。
4、轉(zhuǎn)膜(得到好結(jié)果的關(guān)鍵步驟)
一定一定要避免氣泡?。。馀葜饕袃蓚€(gè)來(lái)源:(1)制作轉(zhuǎn)膜三明治的時(shí)候沒(méi)有趕盡氣泡。濾紙和膠,膠和膜,膜和濾紙之間一定要把氣泡趕盡,有氣泡就會(huì)斷路,斷路蛋白就沒(méi)法遷移到膜上。(2)從電泳液攜帶過(guò)來(lái)的小氣泡。一般電泳過(guò)的膠不要直接放轉(zhuǎn)膜液里,自來(lái)水沖洗一下,把上面的小氣泡沖掉,保證開(kāi)始轉(zhuǎn)膜時(shí)轉(zhuǎn)膜液里沒(méi)有氣泡。另外,一層一層放置膜和濾紙時(shí),要先把濾紙或者膜的一邊放到膠上,然后緩緩把剩下的濾紙覆蓋到膠上,可以避免有氣泡。
轉(zhuǎn)膜液回收可以,但記得每次用回收的轉(zhuǎn)膜液補(bǔ)一點(diǎn)兒甲醇,增加降溫效果。
5、封閉(沒(méi)啥好說(shuō)的)
6、孵一抗
一抗很貴,所以盡量回收??梢杂胹anta的含疊氮鈉PBS和BSA配制成5%(m/v)的一抗稀釋液,四度放置。一次可以配4-5ml,可以用2-3個(gè)月。個(gè)人感覺(jué)挺劃算(ps:用這個(gè)方法博士都只用了一支抗體,還沒(méi)用完)。
一抗的最佳工作濃度要自己測(cè),別迷信說(shuō)明書(shū),自己設(shè)幾個(gè)濃度梯度1:500,1:1000,1:2000,你會(huì)發(fā)現(xiàn)有的1:1000的抗體,其實(shí)用1:2000效果可能更好。另外,不是抗體越濃越好出條帶(1:5000能出的條帶,1:1000卻一團(tuán)黑),抗體濃度要摸?。。?/p>
7、孵二抗和曝光就沒(méi)什么好說(shuō)的了,基本前面的注意了,后面幾乎能出出好條帶。
暫時(shí)想到這么多,大家有不同意見(jiàn)或者更好的方法的,可以說(shuō)出來(lái)大家一起討論。
供參考。