基本概念
我們一般說(shuō)的測(cè)序數(shù)據(jù)，比方說(shuō) 6G 的測(cè)序數(shù)據(jù)，這個(gè)G代表的是 Gbase，而非文件大小 GB（gigabyte)
Gbase 代表的是堿基數(shù)量，即測(cè)序文件（A,T,C,G）的個(gè)數(shù)，相鄰兩個(gè)單位換算為 1000

而我們所說(shuō)的文件大小 GB（gigabyte)是計(jì)算基領(lǐng)域統(tǒng)計(jì)某個(gè)文件大小的計(jì)量單位，相鄰兩個(gè)單位換算為 1024

如何估算fastq文件的的堿基數(shù)
一般我們測(cè)序數(shù)據(jù)有兩種情況，一種是雙端數(shù)據(jù)（雙端各有150bp），另外一種是單端數(shù)據(jù)（一端300bp）
那么對(duì)于單端數(shù)據(jù)，我們可以先統(tǒng)計(jì)具有reads的行數(shù)有多少行，那么每一個(gè)reads行有300個(gè)堿基，那么總堿基數(shù)為：
總堿基數(shù)(GB) = (總reads的行數(shù) × 300) / 10的9次方

如果是雙端數(shù)據(jù)：
總堿基數(shù) = (總reads的行數(shù) × 2 × 150) / 10的9次方

如果想看實(shí)際比對(duì)下來(lái)的總堿基數(shù)，記得乘上比對(duì)率：
單端：總堿基數(shù)(GB) = (總reads的行數(shù) × 300 × 比對(duì)率) / 10的9次方
雙端：總堿基數(shù)(GB) = (總reads的行數(shù) × 2 × 150 × 比對(duì)率) / 10的9次方