在線繪圖|凌波微課云平臺(tái)搞定venn圖

1.?背景介紹

韋恩圖(Venn diagram),是用于展現(xiàn)集合之間大致關(guān)系的一類圖形,常見(jiàn)于多個(gè)或多組樣本共有或特有信息的可視化展示。其中,圓形或橢圓形重合部分(overlap區(qū)域)就是集合與集合元素的交集(共有部分),非重疊部分即為特定集合的特有元素(獨(dú)有部分)。韋恩圖常用于微生物組研究(擴(kuò)增子測(cè)序、宏組學(xué)研究)及轉(zhuǎn)錄組相關(guān)研究中。

工具鏈接:http://www.cloud.biomicroclass.com/CloudPlatform/SoftPage/Venn

2.?操作方法

操作界面

2.1.?參數(shù)設(shè)置

l?展示模式(Display mode):?Arial或Sens-seirf

l?字體選擇(Font family):Arial ?或Sens-seirf ?或Serif?或Monospace

l?字體大?。‵ont size):8px ?9px ?10px ?11px ?12px ?13px ?14px?

l?是否需要根據(jù)統(tǒng)計(jì)列表顯示統(tǒng)計(jì)信息:是?或?否

l?是否顯示開關(guān)按鈕面板(如提供三個(gè)以上列表):是?或?否

l?是否用問(wèn)號(hào)(?)代替交叉點(diǎn)計(jì)數(shù)大?。菏?或?否

l?選擇列表中的元素:?輸入元素名

2.2.?信息上傳

有三種文件錄入方式進(jìn)行VENN圖的繪制:

2.2.1.?直接粘貼:將對(duì)應(yīng)每個(gè)分組(樣品名或分組名)中包含的元素直接粘貼到對(duì)應(yīng)的List列表中;在對(duì)應(yīng)樣品名或分組名的文本框中,可直接修改樣本名/分組名。如下圖示:

數(shù)據(jù)上傳后,將在左側(cè)做圖框,直接展現(xiàn)venn圖及對(duì)應(yīng)列的統(tǒng)計(jì)柱狀圖:

2.2.2.?單文件上傳(適用于一組內(nèi)只有一個(gè)樣本的分析):

第一步:定義上傳參數(shù)

>?分隔方式: 制表符;逗號(hào);分號(hào)

>使用第一行作為標(biāo)題:是 ??否

第二步:瀏覽并選擇文件:這里的文件格式為txt格式,首行為樣本名/分組名,每列為對(duì)應(yīng)樣本名/分組名包含的元素信息。如圖示:

數(shù)據(jù)上傳后,將在左側(cè)做圖框,直接展現(xiàn)venn圖及對(duì)應(yīng)列的統(tǒng)計(jì)柱狀圖:


2.2.3.?元素文件及分組文件上傳(適用于一組包含多個(gè)樣本信息的分析)

第一步:上傳元素列表。這里的文件格式為txt格式,首行為樣本名/分組名,每列為對(duì)應(yīng)樣本名/分組名包含的元素信息。如圖示:

第二步:上傳分組列表。這里的文件格式為txt格式,每一行為一組,一行內(nèi)包含每組的每個(gè)樣本名稱信息,樣本間可以用逗號(hào)分隔開,如圖示:


數(shù)據(jù)上傳后,將在左側(cè)做圖框,直接展現(xiàn)venn圖及對(duì)應(yīng)列的統(tǒng)計(jì)柱狀圖


2.3.?作圖調(diào)整

2.3.1.?顏色調(diào)整:點(diǎn)擊對(duì)應(yīng)分組名或樣本名后的色塊,可以直接調(diào)整該列顯示的作圖顏色,點(diǎn)擊選擇顏色,對(duì)應(yīng)列展示的顏色會(huì)自動(dòng)調(diào)整為選擇的顏色:


2.3.2.?元素構(gòu)成展現(xiàn):

在Venn圖中點(diǎn)擊對(duì)應(yīng)色塊位置,會(huì)在左下方提示框中顯示該色塊內(nèi)包含的元素構(gòu)成


2.4.?結(jié)果導(dǎo)出:

點(diǎn)擊Venn?圖右上角按鈕,可以選擇以PNG、SVG或CSV列表格式導(dǎo)出venn圖分析圖片及分析結(jié)果列表。


其中CSV列表中,包含全部樣本組的共有與特有元素信息,如圖示(局部):


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