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? 查看內(nèi)存信息：free -h

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• 顯示當(dāng)前文件夾的大小
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• 打印變量需要echo 美元符號$可以對變量進行傳遞解釋
  （要區(qū)分跟R的區(qū)別）

  
  
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狀態(tài)變量

位置參數(shù)

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結(jié)構(gòu)化語句

if循環(huán)

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if [ 1 -eq 2 ] 
> then
> echo 1=2
> else
> echo 1!=2

for循環(huán)

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• 對file進行重命名
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  結(jié)果如下
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while循環(huán)

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作業(yè)

注：把每一題的用到的若干命令都粘貼到對應(yīng)的代碼框中

1. 軟件安裝與環(huán)境變量：請安裝一個二進制軟件 bowtie2，包括下載、解壓、調(diào)用 bowtie2 命令的幫助文檔，修改環(huán)境變量 PATH

不需要下載這個軟件，因為服務(wù)器上已經(jīng)有了，拷貝一份即可 /home/hcguo/tmp/biosoft/bowtie2-2.3.4.3-linux-x86_64.zip

# 提示，添加環(huán)境變量需要改一下安裝路徑
echo 'export PATH="安裝路徑:$PATH"' >> ~/.bashrc
echo 'export PATH="/home/hcguo/bowtie2-2.3.4.3-linux-x86_64:$PATH"' >> ~/.bashrc

echo 'export PATH="/trainee2/Sep14/bowtie2-2.3.4.3-linux-x86_64/:$PATH"' >> ~/.bashrc

1. if 語句與狀態(tài)參數(shù)：在上一題修改好了環(huán)境變量之后，回到家目錄，再次調(diào)用 bowtie2 命令的幫助文檔，然后使用 if 語句判斷是否調(diào)用成功（提示：狀態(tài)參數(shù)變量），如果成功，輸出：yes ，否則輸出 no

if  [ $? -eq  0 ] ; then   echo  yes; else  echo no; fi 

1. if 語句與自定義變量：
   • 創(chuàng)建文件 file1
   • 然后判斷當(dāng)前目錄下是否有 file1 這個文件

   • 如果是，輸出：yes ；否則什么都不做

     
     
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touch  file1 
if  [ -f  file1  ]; then echo yes; fi

1. 創(chuàng)建 10 個文件 test_file_1 ~ test_file_10 ，使用循環(huán)語句（建議用 while read id），將上面的 test_file_1 ~ test_file_10 進行重命名，如：test_file_1 改為 test_1

參數(shù)擴展

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腳本編程

vim編輯器

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shell 腳本：為了和普通文本文件區(qū)分開，通常shell腳本都
會以 .sh 為后綴名 。

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