?Genomoviridae: a new familyof widespread single-stranded DNA viruses(Krupovic et al., 2016)
簡介
文章介紹了一個新的侵染真核生物的ssDNA病毒家族，叫做Genomoviridae?(sigil: Ge- for?geminivirus-like, nomo- for?nomovement protein)，目前只有一個Gemycirularvirus?(Gemini-like?myco-infectingcircular virus)屬，該屬目前確定已鑒定的病毒是核盤菌的Sclerotinia sclerotiorum hypovirulence-associated DNA virus 1(SsHADV-1) (Yu et al., 2010)。所以目前這個病毒家族只有SsHADV-1一個病毒（詳情見【現(xiàn)學(xué)現(xiàn)賣】那些DNA真菌病毒）。
然而在環(huán)境，植物，動物等樣品中都發(fā)現(xiàn)了與SsHADV-1相似的ssDNA病毒基因組。說明這個家族的存在十分廣泛（只是檢測到了基因組而已，并沒有像上一篇文章做的那么深入，可能沒有分離病毒粒子，全基因組測序等）。
ssDNA病毒
ssDNA病毒寄主范圍廣，目前ssDNA病毒分為12個不同類群，11個家族和1個未歸類的屬。這個綜述主要介紹Genomoviridae家族和其相似的病毒。
目前為止SsHADV-1是唯一已知的侵染真菌的ssDNA病毒，其特性是病毒粒子可以在胞外傳播（是否可以聯(lián)想，有CP的真菌病毒都有這樣的潛力?；蛘哂械恼婢《炯易迮c植物，動物病毒相似度很高，就也能體外侵染。我的top15 mycoviruses里面會不會存在類似潛力的病毒），這樣很方便的可以通過噴灑施用。但是研究發(fā)現(xiàn)該病毒寄主范圍很?。ㄖ饕刚婢≡髞砥渌麑?shí)驗(yàn)室，從環(huán)境樣本和昆蟲中也分離出來了SsHADV-1。
SsHADV-1-like viruses
人們從各種地方都發(fā)現(xiàn)了SsHADV-1-like viruses，測序發(fā)現(xiàn)它們編碼同源的Rep和CP，構(gòu)建進(jìn)化樹也在同一支?；赗ep構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹表明SsHADV-1和其相似病毒組成了一個很完美的單系進(jìn)化分支，與geminiviruses關(guān)系最近（這兩個病毒的粒子結(jié)構(gòu)不同，且SdHADV-1缺少運(yùn)動蛋白，而在geminiviruses中是必需的）。不同于Rep，SsHADV-1的CP與geminiviruses并不表現(xiàn)明顯的親緣性。
然后列了長達(dá)五頁的表格，多數(shù)寄主是動物（我想可能是它體外侵染能力的一個側(cè)面證明吧）。
(Yu et al., 2013)Extracellular transmission of a DNA mycovirus and its use as a naturalfungicide
簡介
真菌病毒一般沒有體外生活史，不能以病毒粒子形式侵染，因此極大程度限制了它作為生防制劑的使用。而我們發(fā)現(xiàn)了SsHADV-1居然可以了。從感染的真菌中提取的病毒粒子可以直接侵染PDA培養(yǎng)基上無毒的核盤菌菌絲，或者噴灑在葉片上抑制病害蔓延。大田條件下也有很好的效果。病毒粒子在葉片上存活時間可達(dá)10-15d，該病毒寄主范圍很小且不能感染植物或在植物細(xì)胞中移動。
Extracellular Transmission ofSsHADV-1
病毒粒子與真菌原生質(zhì)體或者菌絲體混合，沒有PEG介導(dǎo)下，病毒的侵染效率已經(jīng)很高。直接施用在培養(yǎng)了核盤菌的PDA上也可以造成侵染。以上實(shí)驗(yàn)中病毒粒子的接種濃度是0.05mg/ml。提取的DNA沒有侵染能力。
核盤菌在田間情況復(fù)雜，比較容易產(chǎn)生營養(yǎng)不親和的群體。實(shí)驗(yàn)分離了田間的幾種營養(yǎng)不親和的核盤菌，發(fā)現(xiàn)這個病毒都可以侵染（畢竟有體外入侵途徑，不僅僅依賴于傳統(tǒng)的水平和豎直傳播，營養(yǎng)不親和的限制幾乎沒有）。
SsHADV-1 Inhibits Plant Infectionby S. sclerotiorum.
病毒對植物抵抗核盤菌有很好保護(hù)（或預(yù)防）作用。病毒粒子溶液稀釋到100–500μg/mL時，保護(hù)效果仍然顯著。從實(shí)驗(yàn)植物上分離的核盤菌表現(xiàn)衰弱，所以病毒是通過侵染了真菌，造成真菌衰弱，進(jìn)而對植物起保護(hù)作用。
SsHADV-1 Suppresses Expansion ofLesions Induced by S. sclerotiorum
病毒對已發(fā)病植物上病斑蔓延有抑制作用，即治療效果也比較好。還有大田實(shí)驗(yàn)的結(jié)果顯示，施用病毒可以降低發(fā)病率和病情指數(shù)。
Extracellular Transmission ofSsHADV-1 to Different Sclerotinia Species.
SsHADV-1還可以侵染Sclerotiniaminor 3-4-1和of Sclerotinia nivalis Let-19。但是其他真菌都失敗了，直接混合失敗，PEG介導(dǎo)轉(zhuǎn)化也不行。說明寄主范圍窄，但是同時也說明施用時靶向性高，安全性好。
Stability and Biosafety ofSsHADV-1
這里的安全性主要針對植物。處理植物健康和受傷的葉片，發(fā)現(xiàn)在受傷葉片上10d后，在健康葉片上15d后仍可檢測到病毒。并且葉片樣本中沒有病毒DNA，說明不可在植物中復(fù)制。
檢測在植物中復(fù)制采用的是FISH（熒光原位雜交(Fluorescence in situ hybridization)）技術(shù)，CP生物素化探針，DAPI為對照，圖像直觀。
參考文獻(xiàn)
Krupovic, M.,Ghabrial, S.A., Jiang, D., and Varsani, A. (2016) Genomoviridae: a new familyof widespread single-stranded DNA viruses.?Archivesof virology?161: 2633-2643.
Yu, X., Li, B., Fu, Y., Xie, J.,Cheng, J., Ghabrial, S.A. et al. (2013) Extracellular transmission of a DNAmycovirus and its use as a natural fungicide.?Proceedings of the national academy of sciences?110: 1452-1457.
Yu, X., Li, B., Fu, Y., Jiang,D., Ghabrial, S.A., Li, G. et al. (2010) A geminivirus-related DNA mycovirusthat confers hypovirulence to a plant pathogenic fungus.?Proceedings of the National Academy of Sciences?107: 8387-8392.
