參考文獻
[1]陳劍山,鄭服叢.ITS序列分析在真菌分類鑒定中的應用[J].安徽農(nóng)業(yè)科學,2007(13):3785-3786+3792.DOI:10.13989/j.cnki.0517-6611.2007.13.011.
[2]林曉民,李振岐,王少先.真菌rDNA的特點及在外生菌根菌鑒定中的應用[J].西北農(nóng)業(yè)學報,2005(02):120-125.
ITS序列
在 rDNA 基因中,5.8S rDNA 和 28S rDNA 基因間隔序列稱為ITS序列(內(nèi)源轉(zhuǎn)錄間隔區(qū),Internally Transcribed Spacer),它的長度和序列變化較大,將其擴增物進行 RFLP 或序列分析,可用于對真菌的不同生物型、菌株、種、屬進行分類鑒定。甚至用于區(qū)分關系非常近的種。

ITS結(jié)構(gòu)
ITS鑒定
是指對ITS序列進行DNA測序,通過將測序得到的ITS序列與已知真菌ITS序列比較,從而獲得待測真菌種屬信息的一種方法。應用于真菌種屬鑒定。
rDNA
核糖體DNA(Ribosomal DNA,rDNA)是一種DNA序列,該序列用于rRNA編碼。核糖體是蛋白質(zhì)和rRNA分子的組合,翻譯mRNA分子以產(chǎn)生蛋白質(zhì)的組件。真核生物的rDNA包括一個單元段,一個操縱子,以及由NTS、ETS、18S、ITS1、5.8S、ITS2和28S束組成的串聯(lián)重復序列。rDNA的還有另一個基因,由SrRNA基因編碼,位于大多數(shù)真核生物的基因組中。SrDNA序列也存在于果蠅的串聯(lián)重復序列。
rDNA內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū) (ITS) 在外生菌根菌分子鑒定上的作用及應用方法
- 作用
ITS1和ITS2是中度保守區(qū)域, 其保守性基本上表現(xiàn)為種內(nèi)相對一致, 種間差異比較明顯。這種特點使ITS非常適合于真菌物種的分子鑒定以及屬內(nèi)物種間或種內(nèi)差異較明顯的菌群間的系統(tǒng)發(fā)育關系分析。在外生菌根菌的分子鑒定方面, ITS區(qū)段的應用尤為普遍。 - 方法
1.以ITS區(qū)段的長度 (分子量) 作為標記特征進行分子鑒定
2.以ITS區(qū)段的RFLP圖譜作為標記特征進行分子鑒定
3.用特異性引物擴增ITS區(qū)段, 從而達到鑒定的目的
4.設計專一性探針進行分子雜交的鑒定方法
5.根據(jù)DNA序列進行分子鑒定