大司馬桓溫，依仗他的才能和地位，暗中懷有背叛皇帝的心志，曾經(jīng)撫枕感慨道：“男子不能流芳百世，亦當(dāng)遺臭萬(wàn)年！”術(shù)士杜炅，能預(yù)測(cè)人的貴賤，桓溫問(wèn)他自己的官位能到什么地步，杜炅說(shuō)：“明公的功勛舉世無(wú)雙，官位能到大臣的頂峰。”桓溫聽(tīng)后很不高興。
桓溫本想先在河朔建立戰(zhàn)功，以此為自己贏得更大的聲望，回來(lái)后好接受加九錫（是天子賜給諸侯、大臣特殊功勛九種器用之物，是最高禮遇的表示，后來(lái)幾乎成了篡逆的代名詞）的禮遇，結(jié)果在枋頭失敗，他的威赫名聲陷于困頓，受到挫折。
攻克壽春以后，桓溫對(duì)參軍郗超說(shuō)：“這足以雪枋頭的恥辱了吧？”郗超說(shuō)：“還沒(méi)有。”過(guò)了許久，郗超到桓溫的住所留宿，半夜時(shí)分對(duì)桓溫說(shuō)：“明公在這里沒(méi)有考慮什么嗎？”
桓溫問(wèn)道：“你有話想對(duì)我說(shuō)嗎？”
郗超說(shuō)：“明公承擔(dān)著天下的重任，如今以六十高齡，卻在一次大規(guī)模的行動(dòng)中失敗，如果不建立非常的功勛，就不足以鎮(zhèn)服、滿足百姓的愿望！”
桓溫問(wèn)：“那該怎么辦呢？”
郗超說(shuō)：“明公如果不干伊尹放逐太甲、霍光廢黜昌邑王那樣的事情，就無(wú)法建立大的威勢(shì)與權(quán)力，鎮(zhèn)壓四海。”
（伊尹，商朝初年名相，商君太甲不修德政，昏暗暴虐，伊尹便將太甲送入商湯的墓地桐宮反省；霍光，西漢權(quán)臣，曾迎立漢武帝之孫昌邑王劉賀即位，但二十七天后就以淫亂無(wú)道為由廢除了他。）
桓溫素來(lái)懷有此心，對(duì)郗超說(shuō)的深以為然，于是就和他商定計(jì)議。考慮到皇帝司馬奕平素謹(jǐn)慎小心，沒(méi)有什么過(guò)錯(cuò)，而床笫之事最容易進(jìn)行誣陷，于是就說(shuō)：“皇上早就患有陽(yáng)痿，不能生育，是他的寵臣相龍、計(jì)好、朱靈寶與后宮的美人生下了三個(gè)兒子，還要設(shè)立太子賜封王位，轉(zhuǎn)移皇上的基業(yè)?！辈⑦@話秘密地傳播到民間，當(dāng)時(shí)的人們都無(wú)法辨別真假。
隨后，桓溫從廣陵返回姑孰，抵達(dá)建康后，含蓄地勸說(shuō)褚太后，請(qǐng)求廢黜司馬奕，立會(huì)稽王司馬昱為帝，同時(shí)還草擬了詔書(shū)進(jìn)呈給褚太后。
太后當(dāng)時(shí)正在佛堂燒香，內(nèi)侍報(bào)告說(shuō)：“外邊有緊急奏章?！瘪姨蟪鰜?lái)，倚著門(mén)看奏章，剛看了幾行字就說(shuō)：“我本來(lái)就懷疑……”然后向內(nèi)侍要來(lái)筆加上了這樣的話：“我不幸遭受了這樣的種種憂患，想到死去的和活著的，心如刀絞！”
桓溫將百官召集到朝堂，廢立皇帝是歷代所沒(méi)有過(guò)的事情，所以沒(méi)有人知道過(guò)去的典則，百官們都震驚恐懼，桓溫也神色緊張，不知道該怎么辦。
尚書(shū)左仆射王彪之知道事情不能半途而廢，就對(duì)桓溫說(shuō)：“您廢立皇帝，應(yīng)當(dāng)效法前代的成規(guī)?！庇谑蔷兔钊?lái)《漢書(shū)霍光傳》，于是禮節(jié)儀制很快就制定了。王彪之身穿朝服面對(duì)朝廷，神情沉著，毫無(wú)懼色，文武儀規(guī)典則，全都由他決定，朝廷百官因此而服了他。
然后就宣布太后的詔令，廢黜司馬奕為東海王，以丞相會(huì)稽王司馬昱繼承皇位?；笢刈岓矛帯⒑嗍杖×怂抉R奕的印璽綬帶，司馬奕穿著單衣走下西堂，乘著牛車(chē)出了神虎門(mén)，群臣們哭著拜別，桓溫命令部下帶領(lǐng)數(shù)百兵士押送他回到原來(lái)的東海王府。
桓溫率領(lǐng)百官準(zhǔn)備好皇帝的車(chē)乘，到會(huì)稽王的官邸去迎接司馬昱，司馬昱面朝東方流涕，叩拜接受了印璽綬帶，是為簡(jiǎn)文帝?；笢氐哪_有毛病，簡(jiǎn)文帝詔令可以讓他乘車(chē)進(jìn)入殿堂，桓溫事先準(zhǔn)備好辭章，想陳述他廢黜司馬奕的本意，簡(jiǎn)文帝一見(jiàn)到他就流下了眼淚，但桓溫戰(zhàn)戰(zhàn)兢兢，始終沒(méi)能說(shuō)出一句話。
簡(jiǎn)文帝的異母兄弟，太宰武陵王司馬晞，喜愛(ài)習(xí)武練兵，被桓溫所忌恨，想廢黜他，就把此事告訴了王彪之。王彪之說(shuō)：“武陵王是皇室的親族尊者，沒(méi)有明顯的罪過(guò)，不能因?yàn)椴录呻S便廢黜他。您要建立賢明的君主，應(yīng)當(dāng)尊崇輔佐王室，與伊尹、周公具有同樣的美德，這件大事，應(yīng)該再仔細(xì)考慮！”
桓溫說(shuō)：“這已經(jīng)是我決定了的事情，你不要再說(shuō)了?！庇谑巧媳碚f(shuō)：“司馬晞收羅招納輕浮之士，兒子司馬綜自負(fù)殘忍，袁真的叛逆，事情與他有牽連，近來(lái)他猜疑恐懼，將會(huì)成為禍亂的緣由，請(qǐng)求免除司馬晞的官職，讓他以王的身份返回藩地。”簡(jiǎn)文帝同意了，同時(shí)還免除了世子司馬綜等的職務(wù)。
當(dāng)初，殷浩去世的時(shí)候，桓溫曾派人送信吊唁他，殷浩的兒子殷涓即沒(méi)有答復(fù)，也沒(méi)有到桓溫那里去回復(fù)，而是與武陵王司馬晞?dòng)瓮?。廣州刺史庾蘊(yùn)，是庾希的弟弟，一直和桓溫有隔閡?；笢貐拹阂箐?、庾蘊(yùn)宗族的強(qiáng)大，想要滅掉他們，派他的弟弟桓秘去逼迫司馬晃到西堂叩頭自述，說(shuō)司馬晞及他的兒子司馬綜、殷涓、庾倩、庾柔、劉強(qiáng)等人陰謀反叛。
簡(jiǎn)文帝面對(duì)著桓溫流下了眼淚，桓溫把他們?nèi)甲テ饋?lái)送交廷尉（庾倩、庾柔都是庾蘊(yùn)的弟弟）。接著，桓溫又殺掉了司馬奕的三個(gè)兒子和他們的母親。
桓溫再次進(jìn)上表章，請(qǐng)求殺掉司馬晞，言詞非常激烈誠(chéng)懇，簡(jiǎn)文帝就親手寫(xiě)下詔令給桓溫說(shuō)：“如果晉王朝的神靈悠長(zhǎng)，你就不必請(qǐng)示，遵奉執(zhí)行以前的詔令；如果晉王朝的大運(yùn)已去，我就請(qǐng)求避讓賢人的晉升之路?！?/p>
桓溫看了以后，驚慌失色，汗流浹背，于是就改請(qǐng)廢黜司馬晞及他的三個(gè)兒子，將其全家流放到新安郡，又廢了新蔡王司馬晃為庶人，遷徙到衡陽(yáng)。殷涓、庾倩、曹秀、劉強(qiáng)、庾柔全都被滿門(mén)誅殺，庾蘊(yùn)服毒而死。庾蘊(yùn)的哥哥庾友的兒媳婦，是桓豁的女兒，所以桓溫才特別地赦免了他。庾希聽(tīng)說(shuō)了這樁災(zāi)難后，與弟弟庾邈及兒子庾攸之逃到了海陵的胡澤中。
桓溫在誅殺了殷氏、庾氏后，威勢(shì)顯赫至極，謝安看見(jiàn)桓溫，在很遠(yuǎn)的地方就開(kāi)始叩拜，桓溫吃驚地問(wèn)：“謝安，你為什么要這么做呢？”謝安說(shuō)：“沒(méi)有君主叩拜于前，臣下拱手還禮于后的。”
前秦王苻堅(jiān)聽(tīng)說(shuō)了桓溫廢立皇帝的事情，對(duì)群臣們說(shuō)：“桓溫先在灞上失敗，后來(lái)又在枋頭失敗，不能反思過(guò)錯(cuò)自我貶責(zé)以向百姓謝罪，反而還廢黜君主以自我解脫，六十歲的老頭了還做如此舉動(dòng)，他將如何自容于天下呢！諺語(yǔ)有說(shuō)：‘對(duì)妻子憤怒就對(duì)父親耍臉色！’大概說(shuō)的就是桓溫這樣的人吧?！?/p>
