所有資料來源于生信技能樹
1. 常用的可視化R包
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（1）Base
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高級函數(shù)是出圖，低級函數(shù)是添磚加瓦
2.ggplot2語法
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入門級模板
ggplot(data = <DATA>) + <GEOM_FUNCTION>(mapping = aes(<MAPPINGS>))
2.1屬性設(shè)置
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geom_point(mapping = aes(x = displ, y = hwy), color = "blue")
ggplot(data = mpg) +
geom_point(mapping = aes(x = displ, y = hwy),
size = 5, # 點(diǎn)的大小5mm
alpha = 0.5, # 透明度 50%
shape = "※") # 點(diǎn)的形狀
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2.2映射
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顏色設(shè)置方法
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自行指定映射的顏色
R語言顏色
搜索16禁止顏色代碼，替代下圖中的紅框
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color是邊框顏色，fill是內(nèi)心顏色
2.3分面
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雙分面
2.4幾何對象
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當(dāng)全局變量和局部變量沖突時(shí)，以局部變量為主?。。?/p>
ggplot(test,aes(x = Sepal.Length,
y = Petal.Length,
color = Species)) +"#color屬于全局變量"
geom_point()+
geom_smooth(color = "black")"#color屬于局部變量"
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ggplot(test,aes(x = Sepal.Length,
y = Petal.Length,
color = Species)) +"#color為全局變量"
geom_point()+
geom_smooth()"#作為局部變量的color已經(jīng)刪除"
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2.5幾何對象
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View(diamonds)
table(diamonds$cut)
ggplot(data = diamonds) +
geom_bar(mapping = aes(x = cut))
ggplot(data = diamonds) +
stat_count(mapping = aes(x = cut))
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ggplot(data = fre) + geom_bar(mapping = aes(x = Var1, y = Freq), stat = "identity")
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ggplot(data = diamonds) + geom_bar(mapping = aes(x = cut, y = ..prop.., group = 1))
y=..prop..
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2.6位置關(guān)系
（1）
2.7坐標(biāo)系
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完成的繪圖模板
ggplot(data = x, mapping = aes(x = Sepal.Width, y = Species,
),
) +
geom_violin(aes(fill=Species))+
geom_boxplot() +
geom_jitter(aes(shape=Species))
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3.ggpubr語法
4.圖片的保存和導(dǎo)出
4.1ggsave
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4.2eoffice
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