KEGG and GO

1. DAVID + 微生信繪圖

2. Metascape

3. Kobas

4. reactome

5. Enrichr

蛋白網(wǎng)站

1. UniProt （強大的蛋白結(jié)構(gòu)和功能注釋網(wǎng)站）

2. HPA（可查看蛋白表達以及亞細胞定位）

3. String （PPI）

4. BioGRID(相互作用蛋白的PPI網(wǎng)絡(luò)圖)

5. TCPA與TCGA相對應(yīng)，用于訪問可視化腫瘤蛋白組學(xué)網(wǎng)站

6. PDB蛋白結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫

7. SWISSMODEL蛋白3D結(jié)構(gòu)預(yù)測

8. Pfam蛋白結(jié)構(gòu)及功能預(yù)測

基因及蛋白分析網(wǎng)站

1. GEPIA可進行基因表達、共表達、預(yù)后等分析

2. TIMER可進行基因表達、共表達、預(yù)后、免疫等分析

3. Cbioportal數(shù)據(jù)庫之神可進行突變、突變結(jié)構(gòu)、共表達富集等分析 網(wǎng)站使用說明

4. Linkedomics可分析基因在不同腫瘤的表達以及相關(guān)基因的表達

5. BioGRID可以查詢基因、蛋白、藥物、PPI、關(guān)聯(lián)基因、GO等可以關(guān)聯(lián)到好多其他網(wǎng)站，功能強大！

6. UALCAN相關(guān)基因以及預(yù)后

7. Depmap腫瘤細胞系、基因、藥物

8. TISIDB查詢基因、基因富集（GO KEGG）、免疫等信息

9. TCPA與TCGA相對應(yīng)，用于訪問可視化腫瘤蛋白組學(xué)網(wǎng)站,關(guān)聯(lián)基因，生存分析

10. CTD藥物基因疾病相互作用分析

11. chilibot可繪制基因表型互作圖

查詢基因信息

1. genecards查詢基因詳細信息 - 非常強大，會直接連接到HGNC/HUGO,NCBI,ensembl,OMIM,UniProt 網(wǎng)站

2. Genome Browser Gateway還可查詢基因啟動子序列

3. DISEASE查詢基因與疾病

4. BioGPS查詢基因詳細信息以及基因在細胞和組織中的表達量

5. EMBL-EBI可查詢基因蛋白化合物信息

6. ensembl基因瀏覽器+gene ID轉(zhuǎn)換

7. TISIDB查詢基因、基因富集（GO KEGG）、免疫等信息

8. Depmap其中集合了CCLE網(wǎng)站信息，可分析腫瘤細胞系、基因、藥物

9. HGNC/HUGO可查詢基因信息

10. COSMIC可查詢基因突變信息

11. OMIM包括文本信息和相關(guān)參考信息、序列紀錄、圖譜和相關(guān)其他數(shù)據(jù)庫。

細胞系信息網(wǎng)站

1. GDSC藥物突變以及表達與細胞系敏感性分析網(wǎng)站

2. Depmap其中集合了CCLE網(wǎng)站信息，可分析腫瘤細胞系、基因、藥物

3. BioGPS可直接檢索基因信息以及基因在細胞系的表達情況

分析關(guān)聯(lián)基因：

1. GEPIA

2. Cbioportal

3. Linkedomics

4. BioGRID

5. TIMER

6. UALCAN

7. UCSC網(wǎng)站有相關(guān)的操作演示

8. TCPA與TCGA相對應(yīng)，用于訪問可視化腫瘤蛋白組學(xué)網(wǎng)站,關(guān)聯(lián)基因，生存分析

生存分析

1. KM-plotter

2. PrognoScan 可分析特殊GEO數(shù)據(jù)集預(yù)后

3. TIMER

4. GEPIA

5. UALCAN

6. UCSC

7. TCPA與TCGA相對應(yīng)，用于訪問可視化腫瘤蛋白組學(xué)網(wǎng)站,關(guān)聯(lián)基因，生存分析

藥物分析

1. GDSC藥物細胞系敏感性分析網(wǎng)站

2. Depmap腫瘤細胞系、基因、藥物

3. BioGRID可以查詢基因、蛋白、藥物、PPI、關(guān)聯(lián)基因、GO等可以關(guān)聯(lián)到好多其他網(wǎng)站，功能強大！

4. CTD藥物基因疾病相互作用分析

5. Drugbank藥物查詢網(wǎng)站

6. EMBL-EBI可查詢基因蛋白化合物信息

7. Open Targets Platform

免疫分析

1. TIMER

2. TISIDB

特殊數(shù)據(jù)庫

1. 自噬數(shù)據(jù)庫

2. eFORGE 表觀遺傳數(shù)據(jù)庫

3. CellMarker 細胞標志物數(shù)據(jù)庫,可用于單細胞測序

4. COSMIC癌癥體細胞突變數(shù)據(jù)庫

通路可視化數(shù)據(jù)庫

1. KEGG

2. Reactome

3. Pathview

Selleckchem : https://www.selleck.cn/ 抑制劑

CRISPRlnc : http://www.crisprlnc.org/ crispr/lncRNA

MRPrimerW2 : http://mrprimerw2.com/ qPCR引物

ChIPprimersDB : https://www.chipprimers.com ChIP-PCR引物

PrimerBank：https://pga.mgh.harvard.edu/primerbank/ qPCR引物

Addgene：http://www.addgene.org/ 載體信息共享網(wǎng)站

2.實驗protocol數(shù)據(jù)庫 Jove : https://www.jove.com 視頻/權(quán)限

bio-protocol : https://bio-protocol.org/cn/default.aspx protocol

Current Protocols : https://currentprotocols.onlinelibrary.wiley.com/ protocol

Nature protocol : https://www.nature.com/nprot/ protocol

Springer Protocols : https://experiments.springernature.com/springer-protocols-closure protocol

Cold Spring Harbor Protocols : http://cshprotocols.cshlp.org/ protocol