Python中的pandas模塊進(jìn)行數(shù)據(jù)分析。
接下來pandas介紹中將學(xué)習(xí)到如下8塊內(nèi)容:
1、數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)簡介:DataFrame和Series
2、數(shù)據(jù)索引index
3、利用pandas查詢數(shù)據(jù)
4、利用pandas的DataFrames進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析
5、利用pandas實(shí)現(xiàn)SQL操作
6、利用pandas進(jìn)行缺失值的處理
7、利用pandas實(shí)現(xiàn)Excel的數(shù)據(jù)透視表功能
8、多層索引的使用

在pandas中有兩類非常重要的數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu),即序列Series和數(shù)據(jù)框DataFrame。Series類似于numpy中的一維數(shù)組,除了通吃一維數(shù)組可用的函數(shù)或方法,而且其可通過索引標(biāo)簽的方式獲取數(shù)據(jù),還具有索引的自動(dòng)對齊功能;DataFrame類似于numpy中的二維數(shù)組,同樣可以通用numpy數(shù)組的函數(shù)和方法,而且還具有其他靈活應(yīng)用,后續(xù)會(huì)介紹到。
序列的創(chuàng)建主要有三種方式:
import?numpy?as?np,?pandas?as?pd
arr1?=?np.arange(10)
arr1
type(arr1)
s1?=?pd.Series(arr1)
s1
type(s1)
dic1?=?{'a':10,'b':20,'c':30,'d':40,'e':50}
dic1
type(dic1)
s2?=?pd.Series(dic1)
s2
type(s2)
3)通過DataFrame中的某一行或某一列創(chuàng)建序列
這部分內(nèi)容我們放在后面講,因?yàn)橄旅婢烷_始將DataFrame的創(chuàng)建。
數(shù)據(jù)框的創(chuàng)建主要有三種方式:
1)通過二維數(shù)組創(chuàng)建數(shù)據(jù)框
arr2?=?np.array(np.arange(12)).reshape(4,3)
arr2
type(arr2)
df1?=?pd.DataFrame(arr2)
df1
type(df1)
2)通過字典的方式創(chuàng)建數(shù)據(jù)框
以下以兩種字典來創(chuàng)建數(shù)據(jù)框,一個(gè)是字典列表,一個(gè)是嵌套字典。
dic2?=?{'a':[1,2,3,4],'b':[5,6,7,8],
'c':[9,10,11,12],'d':[13,14,15,16]}
dic2
type(dic2)
df2?=?pd.DataFrame(dic2)
df2
type(df2)
dic3?=?{'one':{'a':1,'b':2,'c':3,'d':4},
'two':{'a':5,'b':6,'c':7,'d':8},
'three':{'a':9,'b':10,'c':11,'d':12}}
dic3
type(dic3)
df3?=?pd.DataFrame(dic3)
df3
type(df3)
3)通過數(shù)據(jù)框的方式創(chuàng)建數(shù)據(jù)框
df4?=?df3[['one','three']]
df4
type(df4)
s3?=?df3['one']
s3
type(s3)
細(xì)致的朋友可能會(huì)發(fā)現(xiàn)一個(gè)現(xiàn)象,不論是序列也好,還是數(shù)據(jù)框也好,對象的最左邊總有一個(gè)非原始數(shù)據(jù)對象,這個(gè)是什么呢?不錯(cuò),就是我們接下來要介紹的索引。
在我看來,序列或數(shù)據(jù)框的索引有兩大用處,一個(gè)是通過索引值或索引標(biāo)簽獲取目標(biāo)數(shù)據(jù),另一個(gè)是通過索引,可以使序列或數(shù)據(jù)框的計(jì)算、操作實(shí)現(xiàn)自動(dòng)化對齊,下面我們就來看看這兩個(gè)功能的應(yīng)用。
1、通過索引值或索引標(biāo)簽獲取數(shù)據(jù)
s4?=?pd.Series(np.array([1,1,2,3,5,8]))
s4
如果不給序列一個(gè)指定的索引值,則序列自動(dòng)生成一個(gè)從0開始的自增索引??梢酝ㄟ^index查看序列的索引:
s4.index
現(xiàn)在我們?yōu)樾蛄性O(shè)定一個(gè)自定義的索引值:
s4.index?=?['a','b','c','d','e','f']
s4
序列有了索引,就可以通過索引值或索引標(biāo)簽進(jìn)行數(shù)據(jù)的獲?。?/p>
s4[3]
s4['e']
s4[[1,3,5]]
s4[['a','b','d','f']]
s4[:4]
s4['c':]
s4['b':'e']
千萬注意:如果通過索引標(biāo)簽獲取數(shù)據(jù)的話,末端標(biāo)簽所對應(yīng)的值是可以返回的!在一維數(shù)組中,就無法通過索引標(biāo)簽獲取數(shù)據(jù),這也是序列不同于一維數(shù)組的一個(gè)方面。
如果有兩個(gè)序列,需要對這兩個(gè)序列進(jìn)行算術(shù)運(yùn)算,這時(shí)索引的存在就體現(xiàn)的它的價(jià)值了—自動(dòng)化對齊.
s5?=?pd.Series(np.array([10,15,20,30,55,80]),
index?=?['a','b','c','d','e','f'])
s5
s6?=?pd.Series(np.array([12,11,13,15,14,16]),
index?=?['a','c','g','b','d','f'])
s6
s5?+?s6
s5/s6
由于s5中沒有對應(yīng)的g索引,s6中沒有對應(yīng)的e索引,所以數(shù)據(jù)的運(yùn)算會(huì)產(chǎn)生兩個(gè)缺失值NaN。注意,這里的算術(shù)結(jié)果就實(shí)現(xiàn)了兩個(gè)序列索引的自動(dòng)對齊,而非簡單的將兩個(gè)序列加總或相除。對于數(shù)據(jù)框的對齊,不僅僅是行索引的自動(dòng)對齊,同時(shí)也會(huì)自動(dòng)對齊列索引(變量名)
數(shù)據(jù)框中同樣有索引,而且數(shù)據(jù)框是二維數(shù)組的推廣,所以其不僅有行索引,而且還存在列索引,關(guān)于數(shù)據(jù)框中的索引相比于序列的應(yīng)用要強(qiáng)大的多,這部分內(nèi)容將放在數(shù)據(jù)查詢中講解。
這里的查詢數(shù)據(jù)相當(dāng)于R語言里的subset功能,可以通過布爾索引有針對的選取原數(shù)據(jù)的子集、指定行、指定列等。我們先導(dǎo)入一個(gè)student數(shù)據(jù)集:
student?=?pd.io.parsers.read_csv('C:\\Users\\admin\\Desktop\\student.csv')
查詢數(shù)據(jù)的前5行或末尾5行
student.head()
student.tail()
查詢指定的行
student.ix[[0,2,4,5,7]]?#這里的ix索引標(biāo)簽函數(shù)必須是中括號(hào)[]
查詢指定的列
student[['Name','Height','Weight']].head()?#如果多個(gè)列的話,必須使用雙重中括號(hào)
也可以通過ix索引標(biāo)簽查詢指定的列
student.ix[:,['Name','Height','Weight']].head()
查詢指定的行和列
student.ix[[0,2,4,5,7],['Name','Height','Weight']].head()
以上是從行或列的角度查詢數(shù)據(jù)的子集,現(xiàn)在我們來看看如何通過布爾索引實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)的子集查詢。
查詢所有女生的信息
student[student['Sex']=='F']
查詢出所有12歲以上的女生信息
student[(student['Sex']=='F')?&?(student['Age']>12)]
查詢出所有12歲以上的女生姓名、身高和體重
student[(student['Sex']=='F')?&?(student['Age']>12)][['Name','Height','Weight']]
上面的查詢邏輯其實(shí)非常的簡單,需要注意的是,如果是多個(gè)條件的查詢,必須在&(且)或者|(或)的兩端條件用括號(hào)括起來。
pandas模塊為我們提供了非常多的描述性統(tǒng)計(jì)分析的指標(biāo)函數(shù),如總和、均值、最小值、最大值等,我們來具體看看這些函數(shù):
首先隨機(jī)生成三組數(shù)據(jù)
np.random.seed(1234)
d1?=?pd.Series(2*np.random.normal(size?=?100)+3)
d2?=?np.random.f(2,4,size?=?100)
d3?=?np.random.randint(1,100,size?=?100)
d1.count()?#非空元素計(jì)算
d1.min()?#最小值
d1.max()?#最大值
d1.idxmin()?#最小值的位置,類似于R中的which.min函數(shù)
d1.idxmax()?#最大值的位置,類似于R中的which.max函數(shù)
d1.quantile(0.1)?#10%分位數(shù)
d1.sum()?#求和
d1.mean()?#均值
d1.median()?#中位數(shù)
d1.mode()?#眾數(shù)
d1.var()?#方差
d1.std()?#標(biāo)準(zhǔn)差
d1.mad()?#平均絕對偏差
d1.skew()?#偏度
d1.kurt()?#峰度
d1.describe()?#一次性輸出多個(gè)描述性統(tǒng)計(jì)指標(biāo)
必須注意的是,descirbe方法只能針對序列或數(shù)據(jù)框,一維數(shù)組是沒有這個(gè)方法的
這里自定義一個(gè)函數(shù),將這些統(tǒng)計(jì)描述指標(biāo)全部匯總到一起:
def?stats(x):
return?pd.Series([x.count(),x.min(),x.idxmin(),
x.quantile(.25),x.median(),
x.quantile(.75),x.mean(),
x.max(),x.idxmax(),
x.mad(),x.var(),
x.std(),x.skew(),x.kurt()],
index?=?['Count','Min','Whicn_Min',
'Q1','Median','Q3','Mean',
'Max','Which_Max','Mad',
'Var','Std','Skew','Kurt'])
stats(d1)
在實(shí)際的工作中,我們可能需要處理的是一系列的數(shù)值型數(shù)據(jù)框,如何將這個(gè)函數(shù)應(yīng)用到數(shù)據(jù)框中的每一列呢?可以使用apply函數(shù),這個(gè)非常類似于R中的apply的應(yīng)用方法。
將之前創(chuàng)建的d1,d2,d3數(shù)據(jù)構(gòu)建數(shù)據(jù)框:
df?=?pd.DataFrame(np.array([d1,d2,d3]).T,columns=['x1','x2','x3'])
df.head()
df.apply(stats)
非常完美,就這樣很簡單的創(chuàng)建了數(shù)值型數(shù)據(jù)的統(tǒng)計(jì)性描述。如果是離散型數(shù)據(jù)呢?就不能用這個(gè)統(tǒng)計(jì)口徑了,我們需要統(tǒng)計(jì)離散變量的觀測數(shù)、唯一值個(gè)數(shù)、眾數(shù)水平及個(gè)數(shù)。你只需要使用describe方法就可以實(shí)現(xiàn)這樣的統(tǒng)計(jì)了。
student['Sex'].describe()
除以上的簡單描述性統(tǒng)計(jì)之外,還提供了連續(xù)變量的相關(guān)系數(shù)(corr)和協(xié)方差矩陣(cov)的求解,這個(gè)跟R語言是一致的用法。
df.corr()
關(guān)于相關(guān)系數(shù)的計(jì)算可以調(diào)用pearson方法或kendell方法或spearman方法,默認(rèn)使用pearson方法。
df.corr('spearman')
如果只想關(guān)注某一個(gè)變量與其余變量的相關(guān)系數(shù)的話,可以使用corrwith,如下方只關(guān)心x1與其余變量的相關(guān)系數(shù):
df.corrwith(df['x1'])
數(shù)值型變量間的協(xié)方差矩陣
df.cov()
五、類似于SQL的操作
在SQL中常見的操作主要是增、刪、改、查幾個(gè)動(dòng)作,那么pandas能否實(shí)現(xiàn)對數(shù)據(jù)的這幾項(xiàng)操作呢?答案是Of Course!
In?[99]:?dic?=?{'Name':['LiuShunxiang','Zhangshan'],
...:?'Sex':['M','F'],'Age':[27,23],
...:?'Height':[165.7,167.2],'Weight':[61,63]}
In?[100]:?student2?=?pd.DataFrame(dic)
In?[101]:?student2
Out[101]:
Age?Height?Name?Sex?Weight
0?27?165.7?LiuShunxiang?M?61
1?23?167.2?Zhangshan?F?63
現(xiàn)在將student2中的數(shù)據(jù)新增到student中,可以通過concat函數(shù)實(shí)現(xiàn):

注意到了嗎?在數(shù)據(jù)庫中union必須要求兩張表的列順序一致,而這里concat函數(shù)可以自動(dòng)對齊兩個(gè)數(shù)據(jù)框的變量!
新增列的話,其實(shí)在pandas中就更簡單了,例如在student2中新增一列學(xué)生成績:

對于新增的列沒有賦值,就會(huì)出現(xiàn)空NaN的形式。
刪除數(shù)據(jù)框student2,通過del命令實(shí)現(xiàn),該命令可以刪除Python的所有對象。

刪除指定的行

原數(shù)據(jù)中的第1,2,4,7行的數(shù)據(jù)已經(jīng)被刪除了。
根據(jù)布爾索引刪除行數(shù)據(jù),其實(shí)這個(gè)刪除就是保留刪除條件的反面數(shù)據(jù),例如刪除所有14歲以下的學(xué)生:

刪除指定的列

我們發(fā)現(xiàn),不論是刪除行還是刪除列,都可以通過drop方法實(shí)現(xiàn),只需要設(shè)定好刪除的軸即可,即調(diào)整drop方法中的axis參數(shù)。默認(rèn)該參數(shù)為0,表示刪除行觀測,如果需要?jiǎng)h除列變量,則需設(shè)置為1。
如果發(fā)現(xiàn)表中的某些數(shù)據(jù)錯(cuò)誤了,如何更改原來的值呢?我們試試結(jié)合布爾索引和賦值的方法:
例如發(fā)現(xiàn)student3中姓名為Liushunxiang的學(xué)生身高錯(cuò)了,應(yīng)該是173,如何改呢?

這樣就可以把原來的身高修改為現(xiàn)在的170了。
看,關(guān)于索引的操作非常靈活、方便吧,就這樣輕松搞定數(shù)據(jù)的更改。
查:有關(guān)數(shù)據(jù)查詢部分,上面已經(jīng)介紹過,下面重點(diǎn)講講聚合、排序和多表連接操作。
聚合:pandas模塊中可以通過groupby()函數(shù)實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)的聚合操作
根據(jù)性別分組,計(jì)算各組別中學(xué)生身高和體重的平均值:

如果不對原始數(shù)據(jù)作限制的話,聚合函數(shù)會(huì)自動(dòng)選擇數(shù)值型數(shù)據(jù)進(jìn)行聚合計(jì)算。如果不想對年齡計(jì)算平均值的話,就需要剔除改變量:

groupby還可以使用多個(gè)分組變量,例如根本年齡和性別分組,計(jì)算身高與體重的平均值:

當(dāng)然,還可以對每個(gè)分組計(jì)算多個(gè)統(tǒng)計(jì)量:

是不是很簡單,只需一句就能完成SQL中的SELECT…FROM…GROUP BY…功能,何樂而不為呢?
排序在日常的統(tǒng)計(jì)分析中還是比較常見的操作,我們可以使用order、sort_index和sort_values實(shí)現(xiàn)序列和數(shù)據(jù)框的排序工作:

我們再試試降序排序的設(shè)置:

上面兩個(gè)結(jié)果其實(shí)都是按值排序,并且結(jié)果中都給出了警告信息,即建議使用sort_values()函數(shù)進(jìn)行按值排序。
在數(shù)據(jù)框中一般都是按值排序,例如:

多表之間的連接也是非常常見的數(shù)據(jù)庫操作,連接分內(nèi)連接和外連接,在數(shù)據(jù)庫語言中通過join關(guān)鍵字實(shí)現(xiàn),pandas我比較建議使用merger函數(shù)實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)的各種連接操作。
如下是構(gòu)造一張學(xué)生的成績表:

現(xiàn)在想把學(xué)生表student與學(xué)生成績表score做一個(gè)關(guān)聯(lián),該如何操作呢?

注意,默認(rèn)情況下,merge函數(shù)實(shí)現(xiàn)的是兩個(gè)表之間的內(nèi)連接,即返回兩張表中共同部分的數(shù)據(jù)??梢酝ㄟ^how參數(shù)設(shè)置連接的方式,left為左連接;right為右連接;outer為外連接。

左連接實(shí)現(xiàn)的是保留student表中的所有信息,同時(shí)將score表的信息與之配對,能配多少配多少,對于沒有配對上的Name,將會(huì)顯示成績?yōu)镹aN。
六、缺失值處理
現(xiàn)實(shí)生活中的數(shù)據(jù)是非常雜亂的,其中缺失值也是非常常見的,對于缺失值的存在可能會(huì)影響到后期的數(shù)據(jù)分析或挖掘工作,那么我們該如何處理這些缺失值呢?常用的有三大類方法,即刪除法、填補(bǔ)法和插值法。
刪除法:當(dāng)數(shù)據(jù)中的某個(gè)變量大部分值都是缺失值,可以考慮刪除改變量;當(dāng)缺失值是隨機(jī)分布的,且缺失的數(shù)量并不是很多是,也可以刪除這些缺失的觀測。
替補(bǔ)法:對于連續(xù)型變量,如果變量的分布近似或就是正態(tài)分布的話,可以用均值替代那些缺失值;如果變量是有偏的,可以使用中位數(shù)來代替那些缺失值;對于離散型變量,我們一般用眾數(shù)去替換那些存在缺失的觀測。
插補(bǔ)法:插補(bǔ)法是基于蒙特卡洛模擬法,結(jié)合線性模型、廣義線性模型、決策樹等方法計(jì)算出來的預(yù)測值替換缺失值。
我們這里就介紹簡單的刪除法和替補(bǔ)法:

這是一組含有缺失值的序列,我們可以結(jié)合sum函數(shù)和isnull函數(shù)來檢測數(shù)據(jù)中含有多少缺失值:
In?[130]:?sum(pd.isnull(s))
Out[130]:?9
直接刪除缺失值

默認(rèn)情況下,dropna會(huì)刪除任何含有缺失值的行,我們再構(gòu)造一個(gè)數(shù)據(jù)框試試:

返回結(jié)果表明,數(shù)據(jù)中只要含有缺失值NaN,該數(shù)據(jù)行就會(huì)被刪除,如果使用參數(shù)how=’all’,則表明只刪除所有行為缺失值的觀測。

使用一個(gè)常量來填補(bǔ)缺失值,可以使用fillna函數(shù)實(shí)現(xiàn)簡單的填補(bǔ)工作:
1)用0填補(bǔ)所有缺失值

2)采用前項(xiàng)填充或后向填充

3)使用常量填充不同的列

4)用均值或中位數(shù)填充各自的列

很顯然,在使用填充法時(shí),相對于常數(shù)填充或前項(xiàng)、后項(xiàng)填充,使用各列的眾數(shù)、均值或中位數(shù)填充要更加合理一點(diǎn),這也是工作中常用的一個(gè)快捷手段。
在Excel中有一個(gè)非常強(qiáng)大的功能就是數(shù)據(jù)透視表,通過托拉拽的方式可以迅速的查看數(shù)據(jù)的聚合情況,這里的聚合可以是計(jì)數(shù)、求和、均值、標(biāo)準(zhǔn)差等。
pandas為我們提供了非常強(qiáng)大的函數(shù)pivot_table(),該函數(shù)就是實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)透視表功能的。對于上面所說的一些聚合函數(shù),可以通過參數(shù)aggfunc設(shè)定。我們先看看這個(gè)函數(shù)的語法和參數(shù)吧:
pivot_table(data,values=None,
index=None,
columns=None,
aggfunc='mean',
fill_value=None,
margins=False,
dropna=True,
margins_name='All')
data:需要進(jìn)行數(shù)據(jù)透視表操作的數(shù)據(jù)框
values:指定需要聚合的字段
index:指定某些原始變量作為行索引
columns:指定哪些離散的分組變量
aggfunc:指定相應(yīng)的聚合函數(shù)
fill_value:使用一個(gè)常數(shù)替代缺失值,默認(rèn)不替換
margins:是否進(jìn)行行或列的匯總,默認(rèn)不匯總
dropna:默認(rèn)所有觀測為缺失的列
margins_name:默認(rèn)行匯總或列匯總的名稱為'All'
我們?nèi)匀灰詓tudent表為例,來認(rèn)識(shí)一下數(shù)據(jù)透視表pivot_table函數(shù)的用法:
對一個(gè)分組變量(Sex),一個(gè)數(shù)值變量(Height)作統(tǒng)計(jì)匯總

對一個(gè)分組變量(Sex),兩個(gè)數(shù)值變量(Height,Weight)作統(tǒng)計(jì)匯總

對兩個(gè)分組變量(Sex,Age),兩個(gè)數(shù)值變量(Height,Weight)作統(tǒng)計(jì)匯總

很顯然這樣的結(jié)果并不像Excel中預(yù)期的那樣,該如何變成列聯(lián)表的形式的?很簡單,只需將結(jié)果進(jìn)行非堆疊操作(unstack)即可:

看,這樣的結(jié)果是不是比上面那種看起來更舒服一點(diǎn)?
使用多個(gè)聚合函數(shù)

有關(guān)更多數(shù)據(jù)透視表的操作,可參考《Pandas透視表(pivot_table)詳解》一文,鏈接地址:http://python.jobbole.com/81212/
最后我們再來講講pandas中的一個(gè)重要功能,那就是多層索引。在序列中它可以實(shí)現(xiàn)在一個(gè)軸上擁有多個(gè)索引,就類似于Excel中常見的這種形式:

對于這樣的數(shù)據(jù)格式有什么好處呢?pandas可以幫我們實(shí)現(xiàn)用低維度形式處理高維數(shù)數(shù)據(jù),這里舉個(gè)例子也許你就能明白了:

對于這種多層次索引的序列,取數(shù)據(jù)就顯得非常簡單了:

對于這種多層次索引的序列,我們還可以非常方便的將其轉(zhuǎn)換為數(shù)據(jù)框的形式:

以上針對的是序列的多層次索引,數(shù)據(jù)框也同樣有多層次的索引,而且每條軸上都可以有這樣的索引,就類似于Excel中常見的這種形式:

我們不妨構(gòu)造一個(gè)類似的高維數(shù)據(jù)框:

同樣,數(shù)據(jù)框中的多層索引也可以非常便捷的取出大塊數(shù)據(jù):

在數(shù)據(jù)框中使用多層索引,可以將整個(gè)數(shù)據(jù)集控制在二維表結(jié)構(gòu)中,這對于數(shù)據(jù)重塑和基于分組的操作(如數(shù)據(jù)透視表的生成)比較有幫助。
就拿student二維數(shù)據(jù)框?yàn)槔?,我們?gòu)造一個(gè)多層索引數(shù)據(jù)集:

講到這里,我們關(guān)于pandas模塊的學(xué)習(xí)基本完成,其實(shí)在掌握了pandas這8個(gè)主要的應(yīng)用方法就可以靈活的解決很多工作中的數(shù)據(jù)處理、統(tǒng)計(jì)分析等任務(wù)。有關(guān)更多的pandas介紹,可參考pandas官方文檔:http://pandas.pydata.org/pandas-docs/version/0.17.0/whatsnew.html。
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