安裝R包

鏡像設(shè)置
options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/")
安裝
install.packages(“包”) 或者BiocManager::install(“包”)

加載
library(包)或者require(包)

dplyr的五個(gè)基礎(chǔ)函數(shù)

先導(dǎo)入示例數(shù)據(jù)集

test <- iris[c(1:2,51:52,101:102),]

新增列 mutate()

mutate(test, new = Sepal.Length * Sepal.Width)

按列篩選 select()

select(數(shù)據(jù)框,1) 篩選第一列
select(數(shù)據(jù)框,c(1,5)) 篩選第一和第五列
select(數(shù)據(jù)框,列名) 按照列名篩選

篩選多個(gè)列時(shí)

vars <- c("Petal.Length", "Petal.Width")
select(test, one_of(vars))

按行篩選 filter()

filter(test, Species == "setosa")
filter(test, Species == "setosa"&Sepal.Length > 5 )
filter(test, Species %in% c("setosa","versicolor"))

排序 arrange()

按照指定列排序，默認(rèn)從小到大
arrange(test, Sepal.Length)

用desc從大到小排序
arrange(test, desc(Sepal.Length))

匯總 summarise()

計(jì)算Sepal.Length的平均值和標(biāo)準(zhǔn)差
summarise(test, mean(Sepal.Length), sd(Sepal.Length))

結(jié)合group_by()分組運(yùn)算,先按照Species分組，計(jì)算每組Sepal.Length的平均值和標(biāo)準(zhǔn)差

summarise(group_by(test, Species),mean(Sepal.Length), sd(Sepal.Length))

管道操作 %>% (cmd/ctr + shift + M)

符號(hào)%>%，這是管道操作，其意思是將%>%左邊的對(duì)象傳遞給右邊的函數(shù)，作為第一個(gè)選項(xiàng)的設(shè)置

test %>% group_by(Species) %>% summarise(mean(Sepal.Length), sd(Sepal.Length))

統(tǒng)計(jì)某列unique值 count()
count(test,Species)

處理關(guān)系數(shù)據(jù)

將2個(gè)表進(jìn)行連接，注意：不要引入factor
（options(stringsAsFactors = F)）

inner_join(test1, test2, by = "x") 內(nèi)連，以指定列為準(zhǔn)取交集
left_join(test1, test2, by = 'x') 左連，以指定列為準(zhǔn)，將test2的數(shù)據(jù)補(bǔ)充到test1
full_join( test1, test2, by = 'x') 全連，以指定列為準(zhǔn)取并集
semi_join(x = test1, y = test2, by = 'x') 半連接，返回能夠與y表匹配的x表所有記錄
anti_join(x = test2, y = test1, by = 'x') 反連接，返回?zé)o法與y表匹配的x表的所記錄
bind_rows(test1, test2) 合并，需要兩個(gè)表格列數(shù)相同
bind_cols(test1, test3) 合并，需要兩個(gè)表格行數(shù)相同