第一步：安裝

docker image pull yaanlpc/rgaugury:2.2

第二步：掛載目錄并使用測(cè)試數(shù)據(jù)

docker run -it  --mount=type=bind,source=/40t_1/caix/software/database/pfam,target=/opt/pfam  --mount=type=bind,source=/40t_1/caix/software/database/interproscan-5.60-92.0,target=/opt/interproscan   --mount=type=bind,source=/40t_2/dockers/DataRGAugury,target=/root/input   yaanlpc/rgaugury:2.2 /bin/bash

注意：需要提前下載好interproscan和pfam數(shù)據(jù)庫(kù)。需要預(yù)測(cè)抗性基因的蛋白文件存放到個(gè)人目錄/40t_2/dockers/DataRGAugury，輸出結(jié)果也在此目錄。