成長(zhǎng)禮4|耐藥機(jī)制研究總結(jié)

新的一年,對(duì)于許多熱愛學(xué)習(xí)的小伙伴來說,又是一個(gè)默默成長(zhǎng)然后在春天驚艷所有人的絕佳機(jī)會(huì)。而我們的工作就是成就你的愿望。

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今天為大家?guī)淼谒姆荻Y!總結(jié)了微生物的一些耐藥機(jī)制,研究方法以及相關(guān)的生物信息軟件,相信會(huì)讓你對(duì)微生物耐藥機(jī)制有個(gè)好的了解。

抗生素是20世紀(jì)最重要的醫(yī)學(xué)突破之一,使人類免受多種病原菌的侵害。但與此同時(shí),由于抗生素的不合理使用,細(xì)菌對(duì)抗生素的耐受性越來越強(qiáng),同時(shí)耐藥性出現(xiàn)大規(guī)模傳播,超級(jí)細(xì)菌不斷涌現(xiàn)。如果全球不采取措施遏制抗藥性超級(jí)細(xì)菌的擴(kuò)散,到2050年每年喪生的人數(shù)可能將增加1000萬人。

1. 耐藥基因數(shù)據(jù)庫(kù)介紹系列1

主要介紹一些微生物耐藥機(jī)制中經(jīng)常使用的耐藥數(shù)據(jù)庫(kù)

2. Nucleic Acids Research| oriTfinder: 細(xì)菌耐藥質(zhì)粒接合轉(zhuǎn)移研究工具

主要介紹:接合質(zhì)粒和整合性接合元件(Integrative and conjugative element, ICE)在線分析工具 oriTfinder,接合性質(zhì)粒和ICE的接合轉(zhuǎn)移區(qū)通常由四個(gè)模塊組成:轉(zhuǎn)移起點(diǎn)(oriT)區(qū),松弛酶 (relaxase),IV型伴侶蛋白 (type IV coupling proteins, T4CP)和細(xì)菌IV型分泌系統(tǒng)(type IV secretion system, T4SS)。

3. Nature Microbiology | 耐藥性分析軟件:NanoOK RT package 簡(jiǎn)介

主要介紹:NanoOKRT是一種使用Nanopore測(cè)序數(shù)據(jù)實(shí)時(shí)進(jìn)行菌種分類和抗生素抗性鑒定的工具。

4. Science l 對(duì)多種耐藥真菌有效的新天然產(chǎn)物的研究

主要介紹如何開發(fā)和研究天然抗真菌藥物

5. Virulence |第三代頭孢菌素耐藥肺炎克雷伯菌獲得性耐藥研究

主要介紹第三代頭孢菌素抗性肺炎克雷伯菌超強(qiáng)毒(ST23 MDR- hvKP)臨床菌株(RJA166)的遺傳背景和微生物學(xué)特征。屬于K1血清型的ST23 hvKP菌株攜帶的具有blaDHA-1基因的天然質(zhì)??赊D(zhuǎn)移至hvKP和cKP,可能是肺炎克雷伯菌和其他病原體之間耐藥性快速傳播的原因

6. Nature reviews microbiology | 肺炎克雷伯菌的群體基因組學(xué)研究

主要介紹:基因組學(xué)方法如何提高對(duì)肺炎克雷伯菌分類學(xué),生態(tài)學(xué)和進(jìn)化的理解,以及致病性和抗菌素耐藥性的臨床相關(guān)決定因素的多樣性和分布。

7. Nat Microbiol|噬菌體可使耐藥細(xì)菌恢復(fù)對(duì)抗生素的敏感性

主要是對(duì)耐藥機(jī)制的介紹:常見的細(xì)菌耐藥機(jī)制包括藥物的主動(dòng)外排、細(xì)胞膜膜通透性降低、形成生物膜、藥物作用靶位點(diǎn)改變、產(chǎn)生滅活酶等以及噬菌體是能侵染并裂解殺死細(xì)菌的病毒。

8. 文獻(xiàn)解讀|JHM:破譯一個(gè)連通的湖泊-河流-水庫(kù)系統(tǒng)中抗生素抗性基因及其非生物指示者

主要介紹:在一個(gè)連通的湖泊—河流—水庫(kù)系統(tǒng)中破譯抗生素抗性基因(ARG)的模式以及關(guān)鍵非生物指標(biāo)與ARG的聯(lián)系。

9. 綜述|Nature Reviews Genetics:基于測(cè)序數(shù)據(jù)研究抗菌素抗性的方法和資源

主要介紹:含從傳統(tǒng)的抗生素敏感性測(cè)試到最新的深度學(xué)習(xí)方法,詳細(xì)介紹了抗菌素耐藥性的鑒定和表征方法,于基于測(cè)序的耐藥性發(fā)現(xiàn),并討論了用于抗菌素耐藥性研究的工具和數(shù)據(jù)庫(kù)

10. 綜述|Water Research: 環(huán)境中抗生素抗性基因的溯源追蹤--挑戰(zhàn)、進(jìn)展和展望

主要介紹:討論有關(guān)環(huán)境ARG污染溯源追蹤研究中的挑戰(zhàn)和進(jìn)展,并且會(huì)特別關(guān)注近期宏基因組學(xué)的方法進(jìn)展。提出了一個(gè)基于宏基因組學(xué)的綜合框架,在該框架中結(jié)合了實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)和宏基因組學(xué)分析,將有助于實(shí)現(xiàn)在ARG污染換幾個(gè)鬧鐘功能中進(jìn)行可靠的溯源追蹤。

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重磅|全國(guó)耐藥檢測(cè)網(wǎng)發(fā)布2014-2019年細(xì)菌耐藥性監(jiān)測(cè)報(bào)告mp.weixin.qq.com細(xì)菌基因組分析常用軟件整理(含下載鏈接)mp.weixin.qq.com微生物/分子實(shí)驗(yàn)資料分享mp.weixin.qq.com

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