利用matplotlib保存圖片

with plt.rc_context({
            'figure.figsize':[6,4],
            'savefig.dpi':300
            }):
    mpl.rcParams['pdf.fonttype'] = 42
    mpl.rcParams['ps.fonttype'] = 42
    sc.pl.umap(
    adata,
    color="Cluster",
    palette=cycler(color=mpl_cm.tab20.colors),show=False)
    plt.savefig("/home/FigS_cell_annotation.pdf", bbox_inches="tight",format="pdf")

ref

這個(gè)很重要！

一定要保存為嵌入字體信息的PDF，不然在AI中打開(kāi)，字體是以錨點(diǎn)保存的

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